Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Upp2Q8CGR7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Upp2Q8CGR7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Upp2Q8CGR7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Upp2Q8CGR7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Upp2Q8CGR7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Upp2Q8CGR7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Upp2Q8CGR7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Upp2Q8CGR7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Upp2Q8CGR7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Upp2Q8CGR7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Upp2Q8CGR7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Upp2Q8CGR7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Upp2Q8CGR7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Upp2Q8CGR7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Upp2Q8CGR7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Upp2Q8CGR7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Upp2Q8CGR7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Upp2Q8CGR7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Upp2Q8CGR7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Upp2Q8CGR7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Upp2Q8CGR7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Upp2Q8CGR7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Upp2Q8CGR7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Upp2Q8CGR7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Upp2Q8CGR7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Upp2Q8CGR7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Upp2Q8CGR7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Upp2Q8CGR7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Upp2Q8CGR7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Upp2Q8CGR7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Upp2Q8CGR7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Upp2Q8CGR7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Upp2Q8CGR7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Upp2Q8CGR7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Upp2Q8CGR7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Upp2Q8CGR7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Upp2Q8CGR7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Upp2Q8CGR7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Upp2Q8CGR7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Upp2Q8CGR7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Upp2Q8CGR7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Upp2Q8CGR7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Upp2Q8CGR7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Upp2Q8CGR7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Upp2Q8CGR7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Upp2Q8CGR7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Upp2Q8CGR7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Upp2Q8CGR7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Upp2Q8CGR7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Upp2Q8CGR7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Upp2Q8CGR7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Upp2Q8CGR7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Upp2Q8CGR7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Upp2Q8CGR7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Upp2Q8CGR7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Upp2Q8CGR7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Upp2Q8CGR7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Upp2Q8CGR7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Upp2Q8CGR7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Upp2Q8CGR7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Upp2Q8CGR7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Upp2Q8CGR7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Upp2Q8CGR7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Upp2Q8CGR7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Upp2Q8CGR7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Upp2Q8CGR7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Upp2Q8CGR7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Upp2Q8CGR7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Upp2Q8CGR7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Upp2Q8CGR7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Upp2Q8CGR7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Upp2Q8CGR7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Upp2Q8CGR7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Upp2Q8CGR7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Upp2Q8CGR7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Upp2Q8CGR7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Upp2Q8CGR7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Upp2Q8CGR7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Upp2Q8CGR7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Upp2Q8CGR7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Upp2Q8CGR7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Upp2Q8CGR7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Upp2Q8CGR7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Upp2Q8CGR7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Upp2Q8CGR7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Upp2Q8CGR7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Upp2Q8CGR7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Upp2Q8CGR7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Upp2Q8CGR7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Upp2Q8CGR7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Upp2Q8CGR7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Upp2Q8CGR7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Upp2Q8CGR7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Upp2Q8CGR7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Upp2Q8CGR7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Upp2Q8CGR7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Upp2Q8CGR7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Upp2Q8CGR7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Upp2Q8CGR7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1227.3 ms