Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nup88Q8CEC0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nup88Q8CEC0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nup88Q8CEC0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nup88Q8CEC0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nup88Q8CEC0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nup88Q8CEC0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nup88Q8CEC0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nup88Q8CEC0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nup88Q8CEC0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nup88Q8CEC0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Nup88Q8CEC0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nup88Q8CEC0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nup88Q8CEC0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nup88Q8CEC0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nup88Q8CEC0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nup88Q8CEC0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nup88Q8CEC0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nup88Q8CEC0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nup88Q8CEC0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nup88Q8CEC0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nup88Q8CEC0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nup88Q8CEC0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nup88Q8CEC0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nup88Q8CEC0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nup88Q8CEC0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nup88Q8CEC0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nup88Q8CEC0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nup88Q8CEC0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Nup88Q8CEC0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Nup88Q8CEC0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nup88Q8CEC0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nup88Q8CEC0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nup88Q8CEC0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nup88Q8CEC0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nup88Q8CEC0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nup88Q8CEC0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nup88Q8CEC0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nup88Q8CEC0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nup88Q8CEC0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nup88Q8CEC0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nup88Q8CEC0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nup88Q8CEC0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nup88Q8CEC0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nup88Q8CEC0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nup88Q8CEC0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nup88Q8CEC0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nup88Q8CEC0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nup88Q8CEC0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nup88Q8CEC0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Nup88Q8CEC0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nup88Q8CEC0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nup88Q8CEC0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nup88Q8CEC0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nup88Q8CEC0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nup88Q8CEC0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nup88Q8CEC0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nup88Q8CEC0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nup88Q8CEC0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nup88Q8CEC0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nup88Q8CEC0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nup88Q8CEC0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nup88Q8CEC0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nup88Q8CEC0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Nup88Q8CEC0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Nup88Q8CEC0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nup88Q8CEC0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nup88Q8CEC0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nup88Q8CEC0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nup88Q8CEC0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nup88Q8CEC0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nup88Q8CEC0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nup88Q8CEC0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nup88Q8CEC0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nup88Q8CEC0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Nup88Q8CEC0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nup88Q8CEC0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nup88Q8CEC0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nup88Q8CEC0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nup88Q8CEC0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Nup88Q8CEC0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nup88Q8CEC0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Nup88Q8CEC0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nup88Q8CEC0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nup88Q8CEC0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nup88Q8CEC0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nup88Q8CEC0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Nup88Q8CEC0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nup88Q8CEC0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nup88Q8CEC0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nup88Q8CEC0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Nup88Q8CEC0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Nup88Q8CEC0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nup88Q8CEC0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nup88Q8CEC0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nup88Q8CEC0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nup88Q8CEC0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nup88Q8CEC0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Nup88Q8CEC0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nup88Q8CEC0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms