Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9H6

Strip2, Striatin-interacting proteins 2, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strip2Q8C9H6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Strip2Q8C9H6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Strip2Q8C9H6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Strip2Q8C9H6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Strip2Q8C9H6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Strip2Q8C9H6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Strip2Q8C9H6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Strip2Q8C9H6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Strip2Q8C9H6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Strip2Q8C9H6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Strip2Q8C9H6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Strip2Q8C9H6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Strip2Q8C9H6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Strip2Q8C9H6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Strip2Q8C9H6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Strip2Q8C9H6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Strip2Q8C9H6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Strip2Q8C9H6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Strip2Q8C9H6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Strip2Q8C9H6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Strip2Q8C9H6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Strip2Q8C9H6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Strip2Q8C9H6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Strip2Q8C9H6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Strip2Q8C9H6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Strip2Q8C9H6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Strip2Q8C9H6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Strip2Q8C9H6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Strip2Q8C9H6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Strip2Q8C9H6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Strip2Q8C9H6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Strip2Q8C9H6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Strip2Q8C9H6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Strip2Q8C9H6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Strip2Q8C9H6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Strip2Q8C9H6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Strip2Q8C9H6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Strip2Q8C9H6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Strip2Q8C9H6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Strip2Q8C9H6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Strip2Q8C9H6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Strip2Q8C9H6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Strip2Q8C9H6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Strip2Q8C9H6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Strip2Q8C9H6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Strip2Q8C9H6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Strip2Q8C9H6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Strip2Q8C9H6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Strip2Q8C9H6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Strip2Q8C9H6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Strip2Q8C9H6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Strip2Q8C9H6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Strip2Q8C9H6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Strip2Q8C9H6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Strip2Q8C9H6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Strip2Q8C9H6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Strip2Q8C9H6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Strip2Q8C9H6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Strip2Q8C9H6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Strip2Q8C9H6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Strip2Q8C9H6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Strip2Q8C9H6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Strip2Q8C9H6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Strip2Q8C9H6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Strip2Q8C9H6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Strip2Q8C9H6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Strip2Q8C9H6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Strip2Q8C9H6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Strip2Q8C9H6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Strip2Q8C9H6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Strip2Q8C9H6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Strip2Q8C9H6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Strip2Q8C9H6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Strip2Q8C9H6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Strip2Q8C9H6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Strip2Q8C9H6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Strip2Q8C9H6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Strip2Q8C9H6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Strip2Q8C9H6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Strip2Q8C9H6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Strip2Q8C9H6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Strip2Q8C9H6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Strip2Q8C9H6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Strip2Q8C9H6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Strip2Q8C9H6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Strip2Q8C9H6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Strip2Q8C9H6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Strip2Q8C9H6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Strip2Q8C9H6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Strip2Q8C9H6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Strip2Q8C9H6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Strip2Q8C9H6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Strip2Q8C9H6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Strip2Q8C9H6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Strip2Q8C9H6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Strip2Q8C9H6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Strip2Q8C9H6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Strip2Q8C9H6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Strip2Q8C9H6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Strip2Q8C9H6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms