Protein–RNA interactions for Protein: Q8C963

Ccdc159, Coiled-coil domain-containing protein 159, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc159Q8C963 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc159Q8C963 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc159Q8C963 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc159Q8C963 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc159Q8C963 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc159Q8C963 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc159Q8C963 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc159Q8C963 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc159Q8C963 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc159Q8C963 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc159Q8C963 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc159Q8C963 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc159Q8C963 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc159Q8C963 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc159Q8C963 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc159Q8C963 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc159Q8C963 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc159Q8C963 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc159Q8C963 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc159Q8C963 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc159Q8C963 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc159Q8C963 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc159Q8C963 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc159Q8C963 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc159Q8C963 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc159Q8C963 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc159Q8C963 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc159Q8C963 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc159Q8C963 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc159Q8C963 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc159Q8C963 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc159Q8C963 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc159Q8C963 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc159Q8C963 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc159Q8C963 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc159Q8C963 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc159Q8C963 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc159Q8C963 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc159Q8C963 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc159Q8C963 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc159Q8C963 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc159Q8C963 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc159Q8C963 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc159Q8C963 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc159Q8C963 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc159Q8C963 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc159Q8C963 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc159Q8C963 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc159Q8C963 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc159Q8C963 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc159Q8C963 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc159Q8C963 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc159Q8C963 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc159Q8C963 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc159Q8C963 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc159Q8C963 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc159Q8C963 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc159Q8C963 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc159Q8C963 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc159Q8C963 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc159Q8C963 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc159Q8C963 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc159Q8C963 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc159Q8C963 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc159Q8C963 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc159Q8C963 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc159Q8C963 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc159Q8C963 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc159Q8C963 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc159Q8C963 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc159Q8C963 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc159Q8C963 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc159Q8C963 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc159Q8C963 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc159Q8C963 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc159Q8C963 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc159Q8C963 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc159Q8C963 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc159Q8C963 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc159Q8C963 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc159Q8C963 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc159Q8C963 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc159Q8C963 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc159Q8C963 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc159Q8C963 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc159Q8C963 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc159Q8C963 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc159Q8C963 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc159Q8C963 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc159Q8C963 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc159Q8C963 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc159Q8C963 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc159Q8C963 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc159Q8C963 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc159Q8C963 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc159Q8C963 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc159Q8C963 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc159Q8C963 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc159Q8C963 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc159Q8C963 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms