Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6E1

Apol7c, Apolipoprotein L 7c, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7cQ8C6E1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Apol7cQ8C6E1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Apol7cQ8C6E1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Apol7cQ8C6E1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Apol7cQ8C6E1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Apol7cQ8C6E1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Apol7cQ8C6E1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Apol7cQ8C6E1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Apol7cQ8C6E1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Apol7cQ8C6E1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Apol7cQ8C6E1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Apol7cQ8C6E1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Apol7cQ8C6E1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Apol7cQ8C6E1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Apol7cQ8C6E1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Apol7cQ8C6E1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Apol7cQ8C6E1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Apol7cQ8C6E1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Apol7cQ8C6E1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Apol7cQ8C6E1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Apol7cQ8C6E1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Apol7cQ8C6E1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Apol7cQ8C6E1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Apol7cQ8C6E1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Apol7cQ8C6E1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Apol7cQ8C6E1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Apol7cQ8C6E1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Apol7cQ8C6E1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Apol7cQ8C6E1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Apol7cQ8C6E1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Apol7cQ8C6E1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Apol7cQ8C6E1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Apol7cQ8C6E1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Apol7cQ8C6E1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Apol7cQ8C6E1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Apol7cQ8C6E1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Apol7cQ8C6E1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Apol7cQ8C6E1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Apol7cQ8C6E1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Apol7cQ8C6E1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Apol7cQ8C6E1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Apol7cQ8C6E1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Apol7cQ8C6E1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Apol7cQ8C6E1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Apol7cQ8C6E1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Apol7cQ8C6E1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Apol7cQ8C6E1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Apol7cQ8C6E1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Apol7cQ8C6E1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Apol7cQ8C6E1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Apol7cQ8C6E1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apol7cQ8C6E1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apol7cQ8C6E1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apol7cQ8C6E1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apol7cQ8C6E1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apol7cQ8C6E1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Apol7cQ8C6E1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apol7cQ8C6E1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apol7cQ8C6E1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apol7cQ8C6E1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Apol7cQ8C6E1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Apol7cQ8C6E1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Apol7cQ8C6E1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Apol7cQ8C6E1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apol7cQ8C6E1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apol7cQ8C6E1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apol7cQ8C6E1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apol7cQ8C6E1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apol7cQ8C6E1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apol7cQ8C6E1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apol7cQ8C6E1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apol7cQ8C6E1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Apol7cQ8C6E1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Apol7cQ8C6E1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apol7cQ8C6E1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apol7cQ8C6E1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apol7cQ8C6E1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apol7cQ8C6E1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apol7cQ8C6E1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apol7cQ8C6E1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apol7cQ8C6E1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apol7cQ8C6E1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apol7cQ8C6E1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Apol7cQ8C6E1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Apol7cQ8C6E1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apol7cQ8C6E1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apol7cQ8C6E1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apol7cQ8C6E1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apol7cQ8C6E1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apol7cQ8C6E1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apol7cQ8C6E1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apol7cQ8C6E1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apol7cQ8C6E1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apol7cQ8C6E1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apol7cQ8C6E1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apol7cQ8C6E1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apol7cQ8C6E1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Apol7cQ8C6E1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apol7cQ8C6E1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apol7cQ8C6E1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms