Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1R3

Uncharacterized protein C17orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C1R3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q8C1R3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q8C1R3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q8C1R3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q8C1R3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q8C1R3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Q8C1R3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q8C1R3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q8C1R3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q8C1R3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q8C1R3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q8C1R3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q8C1R3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q8C1R3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q8C1R3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q8C1R3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q8C1R3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q8C1R3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q8C1R3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q8C1R3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q8C1R3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q8C1R3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q8C1R3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q8C1R3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q8C1R3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q8C1R3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q8C1R3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q8C1R3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q8C1R3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q8C1R3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q8C1R3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q8C1R3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q8C1R3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q8C1R3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q8C1R3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q8C1R3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q8C1R3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q8C1R3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q8C1R3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q8C1R3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q8C1R3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q8C1R3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Q8C1R3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Q8C1R3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q8C1R3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q8C1R3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q8C1R3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q8C1R3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q8C1R3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q8C1R3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q8C1R3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q8C1R3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q8C1R3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q8C1R3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q8C1R3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q8C1R3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q8C1R3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q8C1R3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q8C1R3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q8C1R3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q8C1R3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q8C1R3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q8C1R3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q8C1R3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q8C1R3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q8C1R3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q8C1R3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q8C1R3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q8C1R3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q8C1R3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q8C1R3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q8C1R3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q8C1R3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q8C1R3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q8C1R3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q8C1R3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q8C1R3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q8C1R3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q8C1R3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q8C1R3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q8C1R3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q8C1R3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q8C1R3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q8C1R3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q8C1R3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q8C1R3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q8C1R3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q8C1R3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q8C1R3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q8C1R3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q8C1R3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q8C1R3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q8C1R3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q8C1R3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q8C1R3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q8C1R3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q8C1R3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q8C1R3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q8C1R3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q8C1R3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms