Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1N8

Defa22, Alpha-defensin 22, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa22Q8C1N8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa22Q8C1N8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa22Q8C1N8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa22Q8C1N8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa22Q8C1N8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa22Q8C1N8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa22Q8C1N8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa22Q8C1N8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa22Q8C1N8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Defa22Q8C1N8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Defa22Q8C1N8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Defa22Q8C1N8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Defa22Q8C1N8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms