Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTV2

Cpsf7, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf7Q8BTV2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpsf7Q8BTV2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpsf7Q8BTV2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cpsf7Q8BTV2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cpsf7Q8BTV2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cpsf7Q8BTV2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cpsf7Q8BTV2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cpsf7Q8BTV2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cpsf7Q8BTV2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpsf7Q8BTV2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpsf7Q8BTV2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpsf7Q8BTV2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpsf7Q8BTV2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cpsf7Q8BTV2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cpsf7Q8BTV2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cpsf7Q8BTV2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cpsf7Q8BTV2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cpsf7Q8BTV2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cpsf7Q8BTV2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cpsf7Q8BTV2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cpsf7Q8BTV2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cpsf7Q8BTV2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cpsf7Q8BTV2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cpsf7Q8BTV2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cpsf7Q8BTV2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cpsf7Q8BTV2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cpsf7Q8BTV2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cpsf7Q8BTV2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cpsf7Q8BTV2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cpsf7Q8BTV2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cpsf7Q8BTV2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cpsf7Q8BTV2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cpsf7Q8BTV2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cpsf7Q8BTV2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cpsf7Q8BTV2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cpsf7Q8BTV2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cpsf7Q8BTV2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cpsf7Q8BTV2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cpsf7Q8BTV2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cpsf7Q8BTV2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cpsf7Q8BTV2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cpsf7Q8BTV2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cpsf7Q8BTV2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cpsf7Q8BTV2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cpsf7Q8BTV2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cpsf7Q8BTV2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cpsf7Q8BTV2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cpsf7Q8BTV2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cpsf7Q8BTV2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cpsf7Q8BTV2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cpsf7Q8BTV2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cpsf7Q8BTV2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cpsf7Q8BTV2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cpsf7Q8BTV2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cpsf7Q8BTV2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cpsf7Q8BTV2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cpsf7Q8BTV2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cpsf7Q8BTV2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cpsf7Q8BTV2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cpsf7Q8BTV2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cpsf7Q8BTV2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpsf7Q8BTV2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpsf7Q8BTV2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpsf7Q8BTV2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpsf7Q8BTV2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpsf7Q8BTV2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cpsf7Q8BTV2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cpsf7Q8BTV2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cpsf7Q8BTV2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cpsf7Q8BTV2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpsf7Q8BTV2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpsf7Q8BTV2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpsf7Q8BTV2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpsf7Q8BTV2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpsf7Q8BTV2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cpsf7Q8BTV2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cpsf7Q8BTV2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cpsf7Q8BTV2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cpsf7Q8BTV2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cpsf7Q8BTV2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cpsf7Q8BTV2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cpsf7Q8BTV2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cpsf7Q8BTV2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cpsf7Q8BTV2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cpsf7Q8BTV2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cpsf7Q8BTV2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cpsf7Q8BTV2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cpsf7Q8BTV2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cpsf7Q8BTV2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cpsf7Q8BTV2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cpsf7Q8BTV2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cpsf7Q8BTV2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cpsf7Q8BTV2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cpsf7Q8BTV2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cpsf7Q8BTV2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cpsf7Q8BTV2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cpsf7Q8BTV2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cpsf7Q8BTV2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cpsf7Q8BTV2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cpsf7Q8BTV2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms