Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ3

Bnc2, Zinc finger protein basonuclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc2Q8BMQ3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bnc2Q8BMQ3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bnc2Q8BMQ3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bnc2Q8BMQ3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bnc2Q8BMQ3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bnc2Q8BMQ3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bnc2Q8BMQ3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bnc2Q8BMQ3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bnc2Q8BMQ3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bnc2Q8BMQ3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bnc2Q8BMQ3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bnc2Q8BMQ3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bnc2Q8BMQ3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bnc2Q8BMQ3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bnc2Q8BMQ3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bnc2Q8BMQ3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bnc2Q8BMQ3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bnc2Q8BMQ3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bnc2Q8BMQ3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bnc2Q8BMQ3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bnc2Q8BMQ3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bnc2Q8BMQ3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bnc2Q8BMQ3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bnc2Q8BMQ3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bnc2Q8BMQ3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bnc2Q8BMQ3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bnc2Q8BMQ3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Bnc2Q8BMQ3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bnc2Q8BMQ3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Bnc2Q8BMQ3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bnc2Q8BMQ3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bnc2Q8BMQ3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bnc2Q8BMQ3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bnc2Q8BMQ3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bnc2Q8BMQ3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bnc2Q8BMQ3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bnc2Q8BMQ3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bnc2Q8BMQ3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bnc2Q8BMQ3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bnc2Q8BMQ3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bnc2Q8BMQ3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bnc2Q8BMQ3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bnc2Q8BMQ3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bnc2Q8BMQ3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bnc2Q8BMQ3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bnc2Q8BMQ3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bnc2Q8BMQ3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Bnc2Q8BMQ3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Bnc2Q8BMQ3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bnc2Q8BMQ3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bnc2Q8BMQ3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bnc2Q8BMQ3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bnc2Q8BMQ3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bnc2Q8BMQ3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bnc2Q8BMQ3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Bnc2Q8BMQ3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bnc2Q8BMQ3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bnc2Q8BMQ3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bnc2Q8BMQ3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bnc2Q8BMQ3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Bnc2Q8BMQ3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bnc2Q8BMQ3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bnc2Q8BMQ3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bnc2Q8BMQ3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bnc2Q8BMQ3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bnc2Q8BMQ3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bnc2Q8BMQ3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bnc2Q8BMQ3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bnc2Q8BMQ3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bnc2Q8BMQ3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bnc2Q8BMQ3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Bnc2Q8BMQ3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Bnc2Q8BMQ3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bnc2Q8BMQ3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bnc2Q8BMQ3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bnc2Q8BMQ3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bnc2Q8BMQ3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Bnc2Q8BMQ3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bnc2Q8BMQ3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Bnc2Q8BMQ3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Bnc2Q8BMQ3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bnc2Q8BMQ3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bnc2Q8BMQ3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bnc2Q8BMQ3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bnc2Q8BMQ3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bnc2Q8BMQ3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bnc2Q8BMQ3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bnc2Q8BMQ3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bnc2Q8BMQ3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bnc2Q8BMQ3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bnc2Q8BMQ3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bnc2Q8BMQ3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bnc2Q8BMQ3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bnc2Q8BMQ3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bnc2Q8BMQ3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bnc2Q8BMQ3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bnc2Q8BMQ3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bnc2Q8BMQ3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bnc2Q8BMQ3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bnc2Q8BMQ3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
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