Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH60

Gopc, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GopcQ8BH60 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GopcQ8BH60 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GopcQ8BH60 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GopcQ8BH60 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GopcQ8BH60 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GopcQ8BH60 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GopcQ8BH60 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GopcQ8BH60 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GopcQ8BH60 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GopcQ8BH60 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GopcQ8BH60 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GopcQ8BH60 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GopcQ8BH60 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GopcQ8BH60 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GopcQ8BH60 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GopcQ8BH60 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GopcQ8BH60 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GopcQ8BH60 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GopcQ8BH60 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GopcQ8BH60 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GopcQ8BH60 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GopcQ8BH60 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GopcQ8BH60 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GopcQ8BH60 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GopcQ8BH60 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GopcQ8BH60 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GopcQ8BH60 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GopcQ8BH60 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GopcQ8BH60 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GopcQ8BH60 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GopcQ8BH60 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GopcQ8BH60 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GopcQ8BH60 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GopcQ8BH60 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GopcQ8BH60 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GopcQ8BH60 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
GopcQ8BH60 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GopcQ8BH60 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GopcQ8BH60 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GopcQ8BH60 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GopcQ8BH60 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GopcQ8BH60 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GopcQ8BH60 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GopcQ8BH60 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GopcQ8BH60 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GopcQ8BH60 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GopcQ8BH60 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GopcQ8BH60 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GopcQ8BH60 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GopcQ8BH60 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GopcQ8BH60 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GopcQ8BH60 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GopcQ8BH60 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GopcQ8BH60 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GopcQ8BH60 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GopcQ8BH60 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GopcQ8BH60 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GopcQ8BH60 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GopcQ8BH60 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GopcQ8BH60 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GopcQ8BH60 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GopcQ8BH60 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GopcQ8BH60 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GopcQ8BH60 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GopcQ8BH60 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GopcQ8BH60 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GopcQ8BH60 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GopcQ8BH60 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GopcQ8BH60 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GopcQ8BH60 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GopcQ8BH60 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GopcQ8BH60 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GopcQ8BH60 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GopcQ8BH60 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GopcQ8BH60 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GopcQ8BH60 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GopcQ8BH60 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GopcQ8BH60 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GopcQ8BH60 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GopcQ8BH60 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GopcQ8BH60 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GopcQ8BH60 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GopcQ8BH60 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GopcQ8BH60 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GopcQ8BH60 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GopcQ8BH60 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GopcQ8BH60 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GopcQ8BH60 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GopcQ8BH60 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GopcQ8BH60 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GopcQ8BH60 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GopcQ8BH60 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GopcQ8BH60 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GopcQ8BH60 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GopcQ8BH60 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GopcQ8BH60 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GopcQ8BH60 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GopcQ8BH60 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GopcQ8BH60 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GopcQ8BH60 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms