Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Cyp4f39Q8BGU0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cyp4f39Q8BGU0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cyp4f39Q8BGU0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cyp4f39Q8BGU0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cyp4f39Q8BGU0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cyp4f39Q8BGU0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cyp4f39Q8BGU0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cyp4f39Q8BGU0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cyp4f39Q8BGU0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cyp4f39Q8BGU0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cyp4f39Q8BGU0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Cyp4f39Q8BGU0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Cyp4f39Q8BGU0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cyp4f39Q8BGU0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cyp4f39Q8BGU0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cyp4f39Q8BGU0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cyp4f39Q8BGU0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cyp4f39Q8BGU0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cyp4f39Q8BGU0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cyp4f39Q8BGU0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cyp4f39Q8BGU0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cyp4f39Q8BGU0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cyp4f39Q8BGU0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cyp4f39Q8BGU0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cyp4f39Q8BGU0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cyp4f39Q8BGU0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cyp4f39Q8BGU0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cyp4f39Q8BGU0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cyp4f39Q8BGU0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Cyp4f39Q8BGU0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cyp4f39Q8BGU0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cyp4f39Q8BGU0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cyp4f39Q8BGU0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cyp4f39Q8BGU0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cyp4f39Q8BGU0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cyp4f39Q8BGU0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cyp4f39Q8BGU0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cyp4f39Q8BGU0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cyp4f39Q8BGU0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cyp4f39Q8BGU0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cyp4f39Q8BGU0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cyp4f39Q8BGU0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cyp4f39Q8BGU0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cyp4f39Q8BGU0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cyp4f39Q8BGU0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cyp4f39Q8BGU0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cyp4f39Q8BGU0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cyp4f39Q8BGU0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Cyp4f39Q8BGU0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cyp4f39Q8BGU0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cyp4f39Q8BGU0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cyp4f39Q8BGU0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cyp4f39Q8BGU0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cyp4f39Q8BGU0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cyp4f39Q8BGU0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cyp4f39Q8BGU0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Cyp4f39Q8BGU0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cyp4f39Q8BGU0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cyp4f39Q8BGU0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cyp4f39Q8BGU0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cyp4f39Q8BGU0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cyp4f39Q8BGU0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cyp4f39Q8BGU0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cyp4f39Q8BGU0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cyp4f39Q8BGU0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cyp4f39Q8BGU0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cyp4f39Q8BGU0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cyp4f39Q8BGU0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cyp4f39Q8BGU0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cyp4f39Q8BGU0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Cyp4f39Q8BGU0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cyp4f39Q8BGU0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cyp4f39Q8BGU0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cyp4f39Q8BGU0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cyp4f39Q8BGU0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cyp4f39Q8BGU0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cyp4f39Q8BGU0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cyp4f39Q8BGU0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cyp4f39Q8BGU0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cyp4f39Q8BGU0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cyp4f39Q8BGU0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cyp4f39Q8BGU0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cyp4f39Q8BGU0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cyp4f39Q8BGU0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cyp4f39Q8BGU0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cyp4f39Q8BGU0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cyp4f39Q8BGU0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cyp4f39Q8BGU0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cyp4f39Q8BGU0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cyp4f39Q8BGU0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cyp4f39Q8BGU0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cyp4f39Q8BGU0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms