Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TwistnbQ78WZ7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TwistnbQ78WZ7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TwistnbQ78WZ7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TwistnbQ78WZ7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TwistnbQ78WZ7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TwistnbQ78WZ7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TwistnbQ78WZ7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TwistnbQ78WZ7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TwistnbQ78WZ7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TwistnbQ78WZ7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TwistnbQ78WZ7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TwistnbQ78WZ7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TwistnbQ78WZ7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TwistnbQ78WZ7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TwistnbQ78WZ7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TwistnbQ78WZ7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TwistnbQ78WZ7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TwistnbQ78WZ7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TwistnbQ78WZ7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TwistnbQ78WZ7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TwistnbQ78WZ7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TwistnbQ78WZ7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TwistnbQ78WZ7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TwistnbQ78WZ7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TwistnbQ78WZ7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TwistnbQ78WZ7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TwistnbQ78WZ7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TwistnbQ78WZ7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TwistnbQ78WZ7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TwistnbQ78WZ7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TwistnbQ78WZ7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TwistnbQ78WZ7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TwistnbQ78WZ7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TwistnbQ78WZ7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TwistnbQ78WZ7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TwistnbQ78WZ7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TwistnbQ78WZ7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TwistnbQ78WZ7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TwistnbQ78WZ7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TwistnbQ78WZ7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TwistnbQ78WZ7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TwistnbQ78WZ7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TwistnbQ78WZ7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TwistnbQ78WZ7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TwistnbQ78WZ7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TwistnbQ78WZ7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TwistnbQ78WZ7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TwistnbQ78WZ7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TwistnbQ78WZ7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TwistnbQ78WZ7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TwistnbQ78WZ7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TwistnbQ78WZ7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TwistnbQ78WZ7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TwistnbQ78WZ7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TwistnbQ78WZ7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TwistnbQ78WZ7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TwistnbQ78WZ7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TwistnbQ78WZ7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TwistnbQ78WZ7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TwistnbQ78WZ7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TwistnbQ78WZ7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TwistnbQ78WZ7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TwistnbQ78WZ7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TwistnbQ78WZ7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TwistnbQ78WZ7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TwistnbQ78WZ7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TwistnbQ78WZ7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TwistnbQ78WZ7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TwistnbQ78WZ7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TwistnbQ78WZ7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TwistnbQ78WZ7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TwistnbQ78WZ7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TwistnbQ78WZ7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TwistnbQ78WZ7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TwistnbQ78WZ7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TwistnbQ78WZ7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TwistnbQ78WZ7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TwistnbQ78WZ7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TwistnbQ78WZ7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TwistnbQ78WZ7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TwistnbQ78WZ7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TwistnbQ78WZ7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TwistnbQ78WZ7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TwistnbQ78WZ7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TwistnbQ78WZ7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TwistnbQ78WZ7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TwistnbQ78WZ7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TwistnbQ78WZ7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TwistnbQ78WZ7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TwistnbQ78WZ7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TwistnbQ78WZ7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TwistnbQ78WZ7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TwistnbQ78WZ7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TwistnbQ78WZ7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TwistnbQ78WZ7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TwistnbQ78WZ7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TwistnbQ78WZ7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TwistnbQ78WZ7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TwistnbQ78WZ7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms