Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmed3Q78IS1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmed3Q78IS1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmed3Q78IS1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmed3Q78IS1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmed3Q78IS1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmed3Q78IS1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmed3Q78IS1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmed3Q78IS1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmed3Q78IS1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmed3Q78IS1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmed3Q78IS1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmed3Q78IS1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmed3Q78IS1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmed3Q78IS1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmed3Q78IS1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmed3Q78IS1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmed3Q78IS1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmed3Q78IS1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmed3Q78IS1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmed3Q78IS1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmed3Q78IS1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmed3Q78IS1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmed3Q78IS1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmed3Q78IS1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmed3Q78IS1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmed3Q78IS1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmed3Q78IS1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmed3Q78IS1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmed3Q78IS1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmed3Q78IS1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmed3Q78IS1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmed3Q78IS1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmed3Q78IS1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmed3Q78IS1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmed3Q78IS1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmed3Q78IS1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmed3Q78IS1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmed3Q78IS1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmed3Q78IS1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmed3Q78IS1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmed3Q78IS1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmed3Q78IS1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmed3Q78IS1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmed3Q78IS1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmed3Q78IS1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmed3Q78IS1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmed3Q78IS1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmed3Q78IS1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmed3Q78IS1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmed3Q78IS1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmed3Q78IS1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmed3Q78IS1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmed3Q78IS1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmed3Q78IS1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmed3Q78IS1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmed3Q78IS1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmed3Q78IS1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmed3Q78IS1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmed3Q78IS1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmed3Q78IS1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmed3Q78IS1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmed3Q78IS1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmed3Q78IS1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmed3Q78IS1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmed3Q78IS1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmed3Q78IS1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmed3Q78IS1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmed3Q78IS1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmed3Q78IS1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmed3Q78IS1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmed3Q78IS1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmed3Q78IS1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmed3Q78IS1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmed3Q78IS1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmed3Q78IS1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmed3Q78IS1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmed3Q78IS1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmed3Q78IS1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmed3Q78IS1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmed3Q78IS1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmed3Q78IS1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmed3Q78IS1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmed3Q78IS1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmed3Q78IS1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmed3Q78IS1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tmed3Q78IS1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmed3Q78IS1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tmed3Q78IS1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmed3Q78IS1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmed3Q78IS1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tmed3Q78IS1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmed3Q78IS1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmed3Q78IS1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmed3Q78IS1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmed3Q78IS1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmed3Q78IS1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmed3Q78IS1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmed3Q78IS1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmed3Q78IS1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms