Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Ncapd3Q6ZQK0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Ncapd3Q6ZQK0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
Ncapd3Q6ZQK0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
Ncapd3Q6ZQK0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Ncapd3Q6ZQK0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Ncapd3Q6ZQK0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Ncapd3Q6ZQK0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
Ncapd3Q6ZQK0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ncapd3Q6ZQK0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ncapd3Q6ZQK0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Ncapd3Q6ZQK0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Ncapd3Q6ZQK0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Ncapd3Q6ZQK0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Ncapd3Q6ZQK0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Ncapd3Q6ZQK0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Ncapd3Q6ZQK0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Ncapd3Q6ZQK0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Ncapd3Q6ZQK0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Ncapd3Q6ZQK0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Ncapd3Q6ZQK0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Ncapd3Q6ZQK0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Ncapd3Q6ZQK0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ncapd3Q6ZQK0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ncapd3Q6ZQK0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ncapd3Q6ZQK0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ncapd3Q6ZQK0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Ncapd3Q6ZQK0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
Ncapd3Q6ZQK0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Ncapd3Q6ZQK0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Ncapd3Q6ZQK0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Ncapd3Q6ZQK0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ncapd3Q6ZQK0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ncapd3Q6ZQK0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ncapd3Q6ZQK0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ncapd3Q6ZQK0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
Ncapd3Q6ZQK0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Ncapd3Q6ZQK0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Ncapd3Q6ZQK0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Ncapd3Q6ZQK0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Ncapd3Q6ZQK0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Ncapd3Q6ZQK0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Ncapd3Q6ZQK0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Ncapd3Q6ZQK0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Ncapd3Q6ZQK0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Ncapd3Q6ZQK0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Ncapd3Q6ZQK0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Ncapd3Q6ZQK0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Ncapd3Q6ZQK0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Ncapd3Q6ZQK0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Ncapd3Q6ZQK0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
Ncapd3Q6ZQK0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Ncapd3Q6ZQK0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Ncapd3Q6ZQK0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Ncapd3Q6ZQK0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
Ncapd3Q6ZQK0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Ncapd3Q6ZQK0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Ncapd3Q6ZQK0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Ncapd3Q6ZQK0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Ncapd3Q6ZQK0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Ncapd3Q6ZQK0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Ncapd3Q6ZQK0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Ncapd3Q6ZQK0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
Ncapd3Q6ZQK0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Ncapd3Q6ZQK0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Ncapd3Q6ZQK0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Ncapd3Q6ZQK0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Ncapd3Q6ZQK0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Ncapd3Q6ZQK0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Ncapd3Q6ZQK0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Ncapd3Q6ZQK0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Ncapd3Q6ZQK0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Ncapd3Q6ZQK0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Ncapd3Q6ZQK0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Ncapd3Q6ZQK0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Ncapd3Q6ZQK0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Ncapd3Q6ZQK0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Ncapd3Q6ZQK0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Ncapd3Q6ZQK0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Ncapd3Q6ZQK0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Ncapd3Q6ZQK0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Ncapd3Q6ZQK0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Ncapd3Q6ZQK0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Ncapd3Q6ZQK0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Ncapd3Q6ZQK0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Ncapd3Q6ZQK0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Ncapd3Q6ZQK0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Ncapd3Q6ZQK0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Ncapd3Q6ZQK0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Ncapd3Q6ZQK0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Ncapd3Q6ZQK0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Ncapd3Q6ZQK0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms