Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NinlQ6ZQ12 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NinlQ6ZQ12 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NinlQ6ZQ12 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NinlQ6ZQ12 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NinlQ6ZQ12 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NinlQ6ZQ12 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NinlQ6ZQ12 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NinlQ6ZQ12 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NinlQ6ZQ12 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NinlQ6ZQ12 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NinlQ6ZQ12 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NinlQ6ZQ12 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
NinlQ6ZQ12 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
NinlQ6ZQ12 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NinlQ6ZQ12 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NinlQ6ZQ12 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NinlQ6ZQ12 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NinlQ6ZQ12 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
NinlQ6ZQ12 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NinlQ6ZQ12 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NinlQ6ZQ12 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NinlQ6ZQ12 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NinlQ6ZQ12 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NinlQ6ZQ12 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NinlQ6ZQ12 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NinlQ6ZQ12 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NinlQ6ZQ12 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NinlQ6ZQ12 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NinlQ6ZQ12 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NinlQ6ZQ12 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
NinlQ6ZQ12 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NinlQ6ZQ12 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NinlQ6ZQ12 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
NinlQ6ZQ12 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
NinlQ6ZQ12 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
NinlQ6ZQ12 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.63
NinlQ6ZQ12 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
NinlQ6ZQ12 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
NinlQ6ZQ12 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NinlQ6ZQ12 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NinlQ6ZQ12 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NinlQ6ZQ12 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NinlQ6ZQ12 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NinlQ6ZQ12 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NinlQ6ZQ12 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NinlQ6ZQ12 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NinlQ6ZQ12 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
NinlQ6ZQ12 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
NinlQ6ZQ12 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
NinlQ6ZQ12 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NinlQ6ZQ12 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
NinlQ6ZQ12 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
NinlQ6ZQ12 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NinlQ6ZQ12 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NinlQ6ZQ12 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NinlQ6ZQ12 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
NinlQ6ZQ12 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
NinlQ6ZQ12 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NinlQ6ZQ12 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NinlQ6ZQ12 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NinlQ6ZQ12 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NinlQ6ZQ12 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NinlQ6ZQ12 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
NinlQ6ZQ12 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NinlQ6ZQ12 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
NinlQ6ZQ12 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
NinlQ6ZQ12 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
NinlQ6ZQ12 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
NinlQ6ZQ12 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NinlQ6ZQ12 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NinlQ6ZQ12 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NinlQ6ZQ12 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
NinlQ6ZQ12 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NinlQ6ZQ12 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
NinlQ6ZQ12 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
NinlQ6ZQ12 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NinlQ6ZQ12 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
NinlQ6ZQ12 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NinlQ6ZQ12 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NinlQ6ZQ12 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
NinlQ6ZQ12 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NinlQ6ZQ12 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NinlQ6ZQ12 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
NinlQ6ZQ12 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
NinlQ6ZQ12 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
NinlQ6ZQ12 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
NinlQ6ZQ12 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
NinlQ6ZQ12 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
NinlQ6ZQ12 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NinlQ6ZQ12 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
NinlQ6ZQ12 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NinlQ6ZQ12 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
NinlQ6ZQ12 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NinlQ6ZQ12 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NinlQ6ZQ12 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
NinlQ6ZQ12 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.59
NinlQ6ZQ12 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
NinlQ6ZQ12 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
NinlQ6ZQ12 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
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