Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU8

Casc1, Protein CASC1, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc1Q6TDU8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Casc1Q6TDU8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Casc1Q6TDU8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Casc1Q6TDU8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Casc1Q6TDU8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Casc1Q6TDU8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Casc1Q6TDU8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Casc1Q6TDU8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Casc1Q6TDU8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Casc1Q6TDU8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Casc1Q6TDU8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Casc1Q6TDU8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Casc1Q6TDU8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Casc1Q6TDU8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Casc1Q6TDU8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Casc1Q6TDU8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Casc1Q6TDU8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Casc1Q6TDU8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Casc1Q6TDU8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Casc1Q6TDU8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Casc1Q6TDU8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Casc1Q6TDU8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Casc1Q6TDU8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Casc1Q6TDU8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Casc1Q6TDU8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Casc1Q6TDU8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Casc1Q6TDU8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Casc1Q6TDU8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Casc1Q6TDU8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Casc1Q6TDU8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Casc1Q6TDU8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Casc1Q6TDU8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Casc1Q6TDU8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Casc1Q6TDU8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Casc1Q6TDU8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Casc1Q6TDU8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Casc1Q6TDU8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Casc1Q6TDU8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Casc1Q6TDU8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Casc1Q6TDU8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Casc1Q6TDU8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Casc1Q6TDU8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Casc1Q6TDU8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Casc1Q6TDU8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Casc1Q6TDU8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Casc1Q6TDU8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Casc1Q6TDU8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Casc1Q6TDU8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Casc1Q6TDU8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Casc1Q6TDU8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Casc1Q6TDU8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Casc1Q6TDU8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Casc1Q6TDU8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Casc1Q6TDU8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Casc1Q6TDU8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Casc1Q6TDU8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Casc1Q6TDU8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Casc1Q6TDU8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Casc1Q6TDU8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Casc1Q6TDU8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Casc1Q6TDU8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Casc1Q6TDU8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Casc1Q6TDU8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Casc1Q6TDU8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Casc1Q6TDU8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Casc1Q6TDU8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Casc1Q6TDU8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Casc1Q6TDU8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Casc1Q6TDU8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Casc1Q6TDU8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Casc1Q6TDU8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Casc1Q6TDU8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Casc1Q6TDU8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Casc1Q6TDU8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Casc1Q6TDU8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Casc1Q6TDU8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Casc1Q6TDU8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Casc1Q6TDU8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Casc1Q6TDU8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Casc1Q6TDU8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Casc1Q6TDU8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Casc1Q6TDU8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Casc1Q6TDU8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Casc1Q6TDU8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Casc1Q6TDU8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Casc1Q6TDU8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Casc1Q6TDU8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Casc1Q6TDU8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Casc1Q6TDU8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Casc1Q6TDU8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Casc1Q6TDU8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Casc1Q6TDU8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Casc1Q6TDU8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Casc1Q6TDU8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Casc1Q6TDU8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Casc1Q6TDU8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Casc1Q6TDU8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Casc1Q6TDU8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Casc1Q6TDU8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Casc1Q6TDU8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms