Protein–RNA interactions for Protein: Q6T707

Scd4, Acyl-CoA desaturase 4, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd4Q6T707 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Scd4Q6T707 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scd4Q6T707 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scd4Q6T707 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scd4Q6T707 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Scd4Q6T707 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scd4Q6T707 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scd4Q6T707 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scd4Q6T707 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scd4Q6T707 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scd4Q6T707 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scd4Q6T707 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scd4Q6T707 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scd4Q6T707 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scd4Q6T707 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scd4Q6T707 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scd4Q6T707 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scd4Q6T707 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scd4Q6T707 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scd4Q6T707 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scd4Q6T707 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scd4Q6T707 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scd4Q6T707 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scd4Q6T707 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scd4Q6T707 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scd4Q6T707 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scd4Q6T707 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scd4Q6T707 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scd4Q6T707 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scd4Q6T707 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scd4Q6T707 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scd4Q6T707 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scd4Q6T707 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scd4Q6T707 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scd4Q6T707 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Scd4Q6T707 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scd4Q6T707 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scd4Q6T707 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scd4Q6T707 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scd4Q6T707 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scd4Q6T707 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scd4Q6T707 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scd4Q6T707 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scd4Q6T707 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Scd4Q6T707 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scd4Q6T707 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scd4Q6T707 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scd4Q6T707 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scd4Q6T707 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scd4Q6T707 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scd4Q6T707 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scd4Q6T707 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Scd4Q6T707 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scd4Q6T707 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scd4Q6T707 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scd4Q6T707 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Scd4Q6T707 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scd4Q6T707 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scd4Q6T707 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scd4Q6T707 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scd4Q6T707 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scd4Q6T707 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scd4Q6T707 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scd4Q6T707 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scd4Q6T707 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scd4Q6T707 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scd4Q6T707 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scd4Q6T707 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Scd4Q6T707 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Scd4Q6T707 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scd4Q6T707 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scd4Q6T707 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scd4Q6T707 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Scd4Q6T707 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scd4Q6T707 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scd4Q6T707 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scd4Q6T707 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scd4Q6T707 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scd4Q6T707 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scd4Q6T707 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scd4Q6T707 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scd4Q6T707 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scd4Q6T707 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scd4Q6T707 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scd4Q6T707 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scd4Q6T707 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Scd4Q6T707 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scd4Q6T707 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scd4Q6T707 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scd4Q6T707 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scd4Q6T707 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scd4Q6T707 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Scd4Q6T707 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scd4Q6T707 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scd4Q6T707 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scd4Q6T707 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scd4Q6T707 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scd4Q6T707 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scd4Q6T707 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scd4Q6T707 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91 ms