Protein–RNA interactions for Protein: Q6R5N8

Tlr13, Toll-like receptor 13, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr13Q6R5N8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tlr13Q6R5N8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tlr13Q6R5N8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Tlr13Q6R5N8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tlr13Q6R5N8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tlr13Q6R5N8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tlr13Q6R5N8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tlr13Q6R5N8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tlr13Q6R5N8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tlr13Q6R5N8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tlr13Q6R5N8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tlr13Q6R5N8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tlr13Q6R5N8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tlr13Q6R5N8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tlr13Q6R5N8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tlr13Q6R5N8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tlr13Q6R5N8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tlr13Q6R5N8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Tlr13Q6R5N8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tlr13Q6R5N8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tlr13Q6R5N8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tlr13Q6R5N8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tlr13Q6R5N8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tlr13Q6R5N8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tlr13Q6R5N8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tlr13Q6R5N8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tlr13Q6R5N8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tlr13Q6R5N8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tlr13Q6R5N8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Tlr13Q6R5N8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tlr13Q6R5N8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tlr13Q6R5N8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tlr13Q6R5N8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tlr13Q6R5N8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tlr13Q6R5N8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tlr13Q6R5N8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tlr13Q6R5N8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tlr13Q6R5N8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tlr13Q6R5N8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tlr13Q6R5N8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tlr13Q6R5N8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tlr13Q6R5N8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tlr13Q6R5N8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tlr13Q6R5N8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tlr13Q6R5N8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tlr13Q6R5N8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tlr13Q6R5N8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tlr13Q6R5N8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tlr13Q6R5N8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tlr13Q6R5N8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Tlr13Q6R5N8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tlr13Q6R5N8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tlr13Q6R5N8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tlr13Q6R5N8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tlr13Q6R5N8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tlr13Q6R5N8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tlr13Q6R5N8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tlr13Q6R5N8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tlr13Q6R5N8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tlr13Q6R5N8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tlr13Q6R5N8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tlr13Q6R5N8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tlr13Q6R5N8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tlr13Q6R5N8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tlr13Q6R5N8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tlr13Q6R5N8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tlr13Q6R5N8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tlr13Q6R5N8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tlr13Q6R5N8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tlr13Q6R5N8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tlr13Q6R5N8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tlr13Q6R5N8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tlr13Q6R5N8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tlr13Q6R5N8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tlr13Q6R5N8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tlr13Q6R5N8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tlr13Q6R5N8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tlr13Q6R5N8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tlr13Q6R5N8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tlr13Q6R5N8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tlr13Q6R5N8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tlr13Q6R5N8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tlr13Q6R5N8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tlr13Q6R5N8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tlr13Q6R5N8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tlr13Q6R5N8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tlr13Q6R5N8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tlr13Q6R5N8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tlr13Q6R5N8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tlr13Q6R5N8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tlr13Q6R5N8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tlr13Q6R5N8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tlr13Q6R5N8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tlr13Q6R5N8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tlr13Q6R5N8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tlr13Q6R5N8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tlr13Q6R5N8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tlr13Q6R5N8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tlr13Q6R5N8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Tlr13Q6R5N8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms