Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI5

Ecm29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm29Q6PDI5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ecm29Q6PDI5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ecm29Q6PDI5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ecm29Q6PDI5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ecm29Q6PDI5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Ecm29Q6PDI5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ecm29Q6PDI5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ecm29Q6PDI5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ecm29Q6PDI5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Ecm29Q6PDI5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ecm29Q6PDI5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ecm29Q6PDI5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ecm29Q6PDI5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ecm29Q6PDI5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ecm29Q6PDI5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ecm29Q6PDI5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ecm29Q6PDI5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ecm29Q6PDI5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ecm29Q6PDI5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ecm29Q6PDI5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Ecm29Q6PDI5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ecm29Q6PDI5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ecm29Q6PDI5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ecm29Q6PDI5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ecm29Q6PDI5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ecm29Q6PDI5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ecm29Q6PDI5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ecm29Q6PDI5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ecm29Q6PDI5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ecm29Q6PDI5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Ecm29Q6PDI5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ecm29Q6PDI5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ecm29Q6PDI5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ecm29Q6PDI5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Ecm29Q6PDI5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ecm29Q6PDI5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ecm29Q6PDI5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ecm29Q6PDI5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ecm29Q6PDI5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ecm29Q6PDI5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ecm29Q6PDI5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ecm29Q6PDI5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ecm29Q6PDI5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ecm29Q6PDI5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ecm29Q6PDI5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ecm29Q6PDI5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ecm29Q6PDI5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ecm29Q6PDI5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Ecm29Q6PDI5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ecm29Q6PDI5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ecm29Q6PDI5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ecm29Q6PDI5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ecm29Q6PDI5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ecm29Q6PDI5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ecm29Q6PDI5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ecm29Q6PDI5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ecm29Q6PDI5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ecm29Q6PDI5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ecm29Q6PDI5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ecm29Q6PDI5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ecm29Q6PDI5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ecm29Q6PDI5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ecm29Q6PDI5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ecm29Q6PDI5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ecm29Q6PDI5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ecm29Q6PDI5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ecm29Q6PDI5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ecm29Q6PDI5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ecm29Q6PDI5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ecm29Q6PDI5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ecm29Q6PDI5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ecm29Q6PDI5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Ecm29Q6PDI5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ecm29Q6PDI5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ecm29Q6PDI5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ecm29Q6PDI5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Ecm29Q6PDI5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Ecm29Q6PDI5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ecm29Q6PDI5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ecm29Q6PDI5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ecm29Q6PDI5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ecm29Q6PDI5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Ecm29Q6PDI5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ecm29Q6PDI5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ecm29Q6PDI5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ecm29Q6PDI5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Ecm29Q6PDI5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Ecm29Q6PDI5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ecm29Q6PDI5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ecm29Q6PDI5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ecm29Q6PDI5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ecm29Q6PDI5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ecm29Q6PDI5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ecm29Q6PDI5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ecm29Q6PDI5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ecm29Q6PDI5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ecm29Q6PDI5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Ecm29Q6PDI5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Ecm29Q6PDI5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ecm29Q6PDI5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms