Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A1

Stmnd1, Stathmin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stmnd1Q6P3A1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stmnd1Q6P3A1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stmnd1Q6P3A1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stmnd1Q6P3A1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stmnd1Q6P3A1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stmnd1Q6P3A1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stmnd1Q6P3A1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stmnd1Q6P3A1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Stmnd1Q6P3A1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stmnd1Q6P3A1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Stmnd1Q6P3A1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stmnd1Q6P3A1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stmnd1Q6P3A1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stmnd1Q6P3A1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stmnd1Q6P3A1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stmnd1Q6P3A1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stmnd1Q6P3A1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stmnd1Q6P3A1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stmnd1Q6P3A1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stmnd1Q6P3A1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stmnd1Q6P3A1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stmnd1Q6P3A1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stmnd1Q6P3A1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stmnd1Q6P3A1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stmnd1Q6P3A1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stmnd1Q6P3A1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stmnd1Q6P3A1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stmnd1Q6P3A1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stmnd1Q6P3A1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stmnd1Q6P3A1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stmnd1Q6P3A1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stmnd1Q6P3A1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stmnd1Q6P3A1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stmnd1Q6P3A1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stmnd1Q6P3A1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stmnd1Q6P3A1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stmnd1Q6P3A1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Stmnd1Q6P3A1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stmnd1Q6P3A1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stmnd1Q6P3A1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stmnd1Q6P3A1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stmnd1Q6P3A1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stmnd1Q6P3A1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stmnd1Q6P3A1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stmnd1Q6P3A1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stmnd1Q6P3A1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stmnd1Q6P3A1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stmnd1Q6P3A1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stmnd1Q6P3A1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stmnd1Q6P3A1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stmnd1Q6P3A1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stmnd1Q6P3A1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stmnd1Q6P3A1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stmnd1Q6P3A1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stmnd1Q6P3A1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stmnd1Q6P3A1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stmnd1Q6P3A1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stmnd1Q6P3A1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stmnd1Q6P3A1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Stmnd1Q6P3A1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stmnd1Q6P3A1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stmnd1Q6P3A1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stmnd1Q6P3A1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stmnd1Q6P3A1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stmnd1Q6P3A1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stmnd1Q6P3A1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stmnd1Q6P3A1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stmnd1Q6P3A1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stmnd1Q6P3A1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stmnd1Q6P3A1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stmnd1Q6P3A1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stmnd1Q6P3A1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stmnd1Q6P3A1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stmnd1Q6P3A1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stmnd1Q6P3A1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stmnd1Q6P3A1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stmnd1Q6P3A1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stmnd1Q6P3A1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stmnd1Q6P3A1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stmnd1Q6P3A1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stmnd1Q6P3A1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stmnd1Q6P3A1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stmnd1Q6P3A1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stmnd1Q6P3A1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stmnd1Q6P3A1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Stmnd1Q6P3A1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Stmnd1Q6P3A1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stmnd1Q6P3A1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stmnd1Q6P3A1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stmnd1Q6P3A1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stmnd1Q6P3A1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stmnd1Q6P3A1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stmnd1Q6P3A1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stmnd1Q6P3A1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stmnd1Q6P3A1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stmnd1Q6P3A1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stmnd1Q6P3A1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stmnd1Q6P3A1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stmnd1Q6P3A1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stmnd1Q6P3A1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 249.1 ms