Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZR5

Skiv2l, Superkiller viralicidic activity 2-like (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skiv2lQ6NZR5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Skiv2lQ6NZR5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Skiv2lQ6NZR5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Skiv2lQ6NZR5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Skiv2lQ6NZR5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Skiv2lQ6NZR5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Skiv2lQ6NZR5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Skiv2lQ6NZR5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Skiv2lQ6NZR5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Skiv2lQ6NZR5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Skiv2lQ6NZR5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Skiv2lQ6NZR5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Skiv2lQ6NZR5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Skiv2lQ6NZR5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Skiv2lQ6NZR5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Skiv2lQ6NZR5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Skiv2lQ6NZR5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Skiv2lQ6NZR5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Skiv2lQ6NZR5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Skiv2lQ6NZR5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Skiv2lQ6NZR5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Skiv2lQ6NZR5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Skiv2lQ6NZR5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Skiv2lQ6NZR5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Skiv2lQ6NZR5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Skiv2lQ6NZR5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Skiv2lQ6NZR5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Skiv2lQ6NZR5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Skiv2lQ6NZR5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Skiv2lQ6NZR5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Skiv2lQ6NZR5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Skiv2lQ6NZR5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Skiv2lQ6NZR5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Skiv2lQ6NZR5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Skiv2lQ6NZR5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Skiv2lQ6NZR5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Skiv2lQ6NZR5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Skiv2lQ6NZR5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Skiv2lQ6NZR5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Skiv2lQ6NZR5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Skiv2lQ6NZR5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Skiv2lQ6NZR5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Skiv2lQ6NZR5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Skiv2lQ6NZR5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Skiv2lQ6NZR5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Skiv2lQ6NZR5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Skiv2lQ6NZR5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Skiv2lQ6NZR5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Skiv2lQ6NZR5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Skiv2lQ6NZR5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Skiv2lQ6NZR5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Skiv2lQ6NZR5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Skiv2lQ6NZR5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Skiv2lQ6NZR5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Skiv2lQ6NZR5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Skiv2lQ6NZR5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Skiv2lQ6NZR5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Skiv2lQ6NZR5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Skiv2lQ6NZR5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Skiv2lQ6NZR5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Skiv2lQ6NZR5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Skiv2lQ6NZR5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Skiv2lQ6NZR5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Skiv2lQ6NZR5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Skiv2lQ6NZR5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Skiv2lQ6NZR5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Skiv2lQ6NZR5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Skiv2lQ6NZR5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Skiv2lQ6NZR5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Skiv2lQ6NZR5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Skiv2lQ6NZR5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Skiv2lQ6NZR5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Skiv2lQ6NZR5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Skiv2lQ6NZR5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Skiv2lQ6NZR5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Skiv2lQ6NZR5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Skiv2lQ6NZR5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Skiv2lQ6NZR5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Skiv2lQ6NZR5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Skiv2lQ6NZR5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Skiv2lQ6NZR5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Skiv2lQ6NZR5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Skiv2lQ6NZR5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Skiv2lQ6NZR5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Skiv2lQ6NZR5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Skiv2lQ6NZR5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Skiv2lQ6NZR5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Skiv2lQ6NZR5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Skiv2lQ6NZR5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Skiv2lQ6NZR5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Skiv2lQ6NZR5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Skiv2lQ6NZR5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Skiv2lQ6NZR5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Skiv2lQ6NZR5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Skiv2lQ6NZR5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Skiv2lQ6NZR5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Skiv2lQ6NZR5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Skiv2lQ6NZR5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Skiv2lQ6NZR5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Skiv2lQ6NZR5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms