Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS60

Fbxo41, F-box only protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo41Q6NS60 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Fbxo41Q6NS60 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Fbxo41Q6NS60 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Fbxo41Q6NS60 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
Fbxo41Q6NS60 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Fbxo41Q6NS60 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Fbxo41Q6NS60 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Fbxo41Q6NS60 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Fbxo41Q6NS60 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Fbxo41Q6NS60 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Fbxo41Q6NS60 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Fbxo41Q6NS60 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Fbxo41Q6NS60 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Fbxo41Q6NS60 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Fbxo41Q6NS60 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
Fbxo41Q6NS60 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
Fbxo41Q6NS60 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Fbxo41Q6NS60 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Fbxo41Q6NS60 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Fbxo41Q6NS60 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Fbxo41Q6NS60 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Fbxo41Q6NS60 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Fbxo41Q6NS60 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Fbxo41Q6NS60 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Fbxo41Q6NS60 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Fbxo41Q6NS60 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Fbxo41Q6NS60 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Fbxo41Q6NS60 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Fbxo41Q6NS60 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Fbxo41Q6NS60 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Fbxo41Q6NS60 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Fbxo41Q6NS60 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Fbxo41Q6NS60 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Fbxo41Q6NS60 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Fbxo41Q6NS60 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Fbxo41Q6NS60 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Fbxo41Q6NS60 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Fbxo41Q6NS60 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Fbxo41Q6NS60 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Fbxo41Q6NS60 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Fbxo41Q6NS60 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Fbxo41Q6NS60 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Fbxo41Q6NS60 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Fbxo41Q6NS60 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Fbxo41Q6NS60 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Fbxo41Q6NS60 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Fbxo41Q6NS60 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Fbxo41Q6NS60 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Fbxo41Q6NS60 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Fbxo41Q6NS60 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Fbxo41Q6NS60 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Fbxo41Q6NS60 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Fbxo41Q6NS60 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Fbxo41Q6NS60 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Fbxo41Q6NS60 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Fbxo41Q6NS60 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Fbxo41Q6NS60 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Fbxo41Q6NS60 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Fbxo41Q6NS60 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.77
Fbxo41Q6NS60 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Fbxo41Q6NS60 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Fbxo41Q6NS60 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Fbxo41Q6NS60 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Fbxo41Q6NS60 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Fbxo41Q6NS60 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Fbxo41Q6NS60 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Fbxo41Q6NS60 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Fbxo41Q6NS60 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Fbxo41Q6NS60 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Fbxo41Q6NS60 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Fbxo41Q6NS60 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Fbxo41Q6NS60 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Fbxo41Q6NS60 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Fbxo41Q6NS60 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Fbxo41Q6NS60 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Fbxo41Q6NS60 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Fbxo41Q6NS60 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Fbxo41Q6NS60 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Fbxo41Q6NS60 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Fbxo41Q6NS60 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Fbxo41Q6NS60 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Fbxo41Q6NS60 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Fbxo41Q6NS60 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Fbxo41Q6NS60 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Fbxo41Q6NS60 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Fbxo41Q6NS60 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Fbxo41Q6NS60 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Fbxo41Q6NS60 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Fbxo41Q6NS60 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Fbxo41Q6NS60 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Fbxo41Q6NS60 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Fbxo41Q6NS60 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Fbxo41Q6NS60 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Fbxo41Q6NS60 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Fbxo41Q6NS60 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Fbxo41Q6NS60 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Fbxo41Q6NS60 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Fbxo41Q6NS60 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Fbxo41Q6NS60 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Fbxo41Q6NS60 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms