Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NipblQ6KCD5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NipblQ6KCD5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NipblQ6KCD5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NipblQ6KCD5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NipblQ6KCD5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NipblQ6KCD5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NipblQ6KCD5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NipblQ6KCD5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NipblQ6KCD5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NipblQ6KCD5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NipblQ6KCD5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NipblQ6KCD5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NipblQ6KCD5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NipblQ6KCD5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NipblQ6KCD5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NipblQ6KCD5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NipblQ6KCD5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NipblQ6KCD5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NipblQ6KCD5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NipblQ6KCD5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NipblQ6KCD5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NipblQ6KCD5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NipblQ6KCD5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NipblQ6KCD5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NipblQ6KCD5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NipblQ6KCD5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NipblQ6KCD5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NipblQ6KCD5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NipblQ6KCD5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NipblQ6KCD5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NipblQ6KCD5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NipblQ6KCD5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NipblQ6KCD5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NipblQ6KCD5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NipblQ6KCD5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NipblQ6KCD5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NipblQ6KCD5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NipblQ6KCD5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NipblQ6KCD5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NipblQ6KCD5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NipblQ6KCD5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NipblQ6KCD5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NipblQ6KCD5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NipblQ6KCD5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NipblQ6KCD5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NipblQ6KCD5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NipblQ6KCD5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NipblQ6KCD5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NipblQ6KCD5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NipblQ6KCD5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NipblQ6KCD5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NipblQ6KCD5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NipblQ6KCD5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NipblQ6KCD5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NipblQ6KCD5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NipblQ6KCD5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NipblQ6KCD5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NipblQ6KCD5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NipblQ6KCD5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NipblQ6KCD5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NipblQ6KCD5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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