Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NipblQ6KCD5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NipblQ6KCD5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NipblQ6KCD5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NipblQ6KCD5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NipblQ6KCD5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NipblQ6KCD5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NipblQ6KCD5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NipblQ6KCD5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NipblQ6KCD5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NipblQ6KCD5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NipblQ6KCD5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NipblQ6KCD5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NipblQ6KCD5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NipblQ6KCD5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NipblQ6KCD5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NipblQ6KCD5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NipblQ6KCD5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NipblQ6KCD5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NipblQ6KCD5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NipblQ6KCD5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NipblQ6KCD5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NipblQ6KCD5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NipblQ6KCD5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NipblQ6KCD5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NipblQ6KCD5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NipblQ6KCD5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NipblQ6KCD5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NipblQ6KCD5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NipblQ6KCD5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NipblQ6KCD5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NipblQ6KCD5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NipblQ6KCD5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NipblQ6KCD5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NipblQ6KCD5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NipblQ6KCD5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NipblQ6KCD5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NipblQ6KCD5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NipblQ6KCD5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NipblQ6KCD5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NipblQ6KCD5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NipblQ6KCD5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NipblQ6KCD5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NipblQ6KCD5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NipblQ6KCD5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NipblQ6KCD5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NipblQ6KCD5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NipblQ6KCD5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NipblQ6KCD5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NipblQ6KCD5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NipblQ6KCD5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NipblQ6KCD5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NipblQ6KCD5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NipblQ6KCD5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NipblQ6KCD5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NipblQ6KCD5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NipblQ6KCD5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NipblQ6KCD5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NipblQ6KCD5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NipblQ6KCD5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NipblQ6KCD5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NipblQ6KCD5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NipblQ6KCD5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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