Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rftn1Q6A0D4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rftn1Q6A0D4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rftn1Q6A0D4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rftn1Q6A0D4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rftn1Q6A0D4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rftn1Q6A0D4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rftn1Q6A0D4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rftn1Q6A0D4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rftn1Q6A0D4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rftn1Q6A0D4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rftn1Q6A0D4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rftn1Q6A0D4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rftn1Q6A0D4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rftn1Q6A0D4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rftn1Q6A0D4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rftn1Q6A0D4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rftn1Q6A0D4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rftn1Q6A0D4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rftn1Q6A0D4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rftn1Q6A0D4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rftn1Q6A0D4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rftn1Q6A0D4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rftn1Q6A0D4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rftn1Q6A0D4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rftn1Q6A0D4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rftn1Q6A0D4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rftn1Q6A0D4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rftn1Q6A0D4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rftn1Q6A0D4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rftn1Q6A0D4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rftn1Q6A0D4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rftn1Q6A0D4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rftn1Q6A0D4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rftn1Q6A0D4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rftn1Q6A0D4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rftn1Q6A0D4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rftn1Q6A0D4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rftn1Q6A0D4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rftn1Q6A0D4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rftn1Q6A0D4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rftn1Q6A0D4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rftn1Q6A0D4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rftn1Q6A0D4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rftn1Q6A0D4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rftn1Q6A0D4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rftn1Q6A0D4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rftn1Q6A0D4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rftn1Q6A0D4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rftn1Q6A0D4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rftn1Q6A0D4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rftn1Q6A0D4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rftn1Q6A0D4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rftn1Q6A0D4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rftn1Q6A0D4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rftn1Q6A0D4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rftn1Q6A0D4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rftn1Q6A0D4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rftn1Q6A0D4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rftn1Q6A0D4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rftn1Q6A0D4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rftn1Q6A0D4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rftn1Q6A0D4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rftn1Q6A0D4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rftn1Q6A0D4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rftn1Q6A0D4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rftn1Q6A0D4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rftn1Q6A0D4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rftn1Q6A0D4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rftn1Q6A0D4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rftn1Q6A0D4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rftn1Q6A0D4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rftn1Q6A0D4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rftn1Q6A0D4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rftn1Q6A0D4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rftn1Q6A0D4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rftn1Q6A0D4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rftn1Q6A0D4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rftn1Q6A0D4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rftn1Q6A0D4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rftn1Q6A0D4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rftn1Q6A0D4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rftn1Q6A0D4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rftn1Q6A0D4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rftn1Q6A0D4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rftn1Q6A0D4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rftn1Q6A0D4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rftn1Q6A0D4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rftn1Q6A0D4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rftn1Q6A0D4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rftn1Q6A0D4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rftn1Q6A0D4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rftn1Q6A0D4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rftn1Q6A0D4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rftn1Q6A0D4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rftn1Q6A0D4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rftn1Q6A0D4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rftn1Q6A0D4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rftn1Q6A0D4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rftn1Q6A0D4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms