Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE8

Znf280d, Zinc finger protein 280D, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf280dQ68FE8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Znf280dQ68FE8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Znf280dQ68FE8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Znf280dQ68FE8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Znf280dQ68FE8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Znf280dQ68FE8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Znf280dQ68FE8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Znf280dQ68FE8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Znf280dQ68FE8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Znf280dQ68FE8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Znf280dQ68FE8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Znf280dQ68FE8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Znf280dQ68FE8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Znf280dQ68FE8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Znf280dQ68FE8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Znf280dQ68FE8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Znf280dQ68FE8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Znf280dQ68FE8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Znf280dQ68FE8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Znf280dQ68FE8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Znf280dQ68FE8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Znf280dQ68FE8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Znf280dQ68FE8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Znf280dQ68FE8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Znf280dQ68FE8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Znf280dQ68FE8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Znf280dQ68FE8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Znf280dQ68FE8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Znf280dQ68FE8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Znf280dQ68FE8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Znf280dQ68FE8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Znf280dQ68FE8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Znf280dQ68FE8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Znf280dQ68FE8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Znf280dQ68FE8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Znf280dQ68FE8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Znf280dQ68FE8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Znf280dQ68FE8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Znf280dQ68FE8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Znf280dQ68FE8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Znf280dQ68FE8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Znf280dQ68FE8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Znf280dQ68FE8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Znf280dQ68FE8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Znf280dQ68FE8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Znf280dQ68FE8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Znf280dQ68FE8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Znf280dQ68FE8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Znf280dQ68FE8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Znf280dQ68FE8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Znf280dQ68FE8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf280dQ68FE8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf280dQ68FE8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf280dQ68FE8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf280dQ68FE8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf280dQ68FE8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf280dQ68FE8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf280dQ68FE8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf280dQ68FE8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf280dQ68FE8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf280dQ68FE8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf280dQ68FE8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Znf280dQ68FE8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Znf280dQ68FE8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Znf280dQ68FE8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Znf280dQ68FE8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Znf280dQ68FE8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Znf280dQ68FE8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Znf280dQ68FE8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Znf280dQ68FE8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Znf280dQ68FE8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Znf280dQ68FE8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Znf280dQ68FE8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Znf280dQ68FE8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Znf280dQ68FE8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Znf280dQ68FE8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Znf280dQ68FE8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Znf280dQ68FE8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf280dQ68FE8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf280dQ68FE8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf280dQ68FE8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Znf280dQ68FE8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Znf280dQ68FE8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Znf280dQ68FE8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Znf280dQ68FE8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Znf280dQ68FE8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Znf280dQ68FE8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Znf280dQ68FE8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Znf280dQ68FE8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Znf280dQ68FE8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Znf280dQ68FE8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Znf280dQ68FE8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Znf280dQ68FE8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Znf280dQ68FE8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Znf280dQ68FE8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Znf280dQ68FE8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Znf280dQ68FE8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Znf280dQ68FE8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Znf280dQ68FE8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Znf280dQ68FE8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms