Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc8eQ66JT1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc8eQ66JT1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc8eQ66JT1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc8eQ66JT1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc8eQ66JT1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc8eQ66JT1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc8eQ66JT1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Lrrc8eQ66JT1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc8eQ66JT1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc8eQ66JT1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc8eQ66JT1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc8eQ66JT1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc8eQ66JT1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc8eQ66JT1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc8eQ66JT1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc8eQ66JT1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc8eQ66JT1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc8eQ66JT1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc8eQ66JT1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc8eQ66JT1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc8eQ66JT1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc8eQ66JT1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc8eQ66JT1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc8eQ66JT1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc8eQ66JT1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc8eQ66JT1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc8eQ66JT1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc8eQ66JT1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc8eQ66JT1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc8eQ66JT1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc8eQ66JT1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc8eQ66JT1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc8eQ66JT1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc8eQ66JT1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc8eQ66JT1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc8eQ66JT1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrc8eQ66JT1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc8eQ66JT1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc8eQ66JT1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc8eQ66JT1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc8eQ66JT1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc8eQ66JT1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc8eQ66JT1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc8eQ66JT1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc8eQ66JT1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc8eQ66JT1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc8eQ66JT1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc8eQ66JT1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc8eQ66JT1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc8eQ66JT1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc8eQ66JT1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc8eQ66JT1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc8eQ66JT1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc8eQ66JT1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc8eQ66JT1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc8eQ66JT1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc8eQ66JT1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc8eQ66JT1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc8eQ66JT1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc8eQ66JT1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc8eQ66JT1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc8eQ66JT1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc8eQ66JT1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc8eQ66JT1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc8eQ66JT1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc8eQ66JT1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc8eQ66JT1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc8eQ66JT1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc8eQ66JT1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc8eQ66JT1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc8eQ66JT1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc8eQ66JT1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc8eQ66JT1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc8eQ66JT1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc8eQ66JT1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc8eQ66JT1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc8eQ66JT1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc8eQ66JT1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc8eQ66JT1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc8eQ66JT1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc8eQ66JT1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc8eQ66JT1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc8eQ66JT1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc8eQ66JT1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc8eQ66JT1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc8eQ66JT1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc8eQ66JT1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc8eQ66JT1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc8eQ66JT1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc8eQ66JT1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc8eQ66JT1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc8eQ66JT1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc8eQ66JT1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc8eQ66JT1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc8eQ66JT1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc8eQ66JT1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc8eQ66JT1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc8eQ66JT1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc8eQ66JT1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms