Protein–RNA interactions for Protein: Q62191

Trim21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim21Q62191 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim21Q62191 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim21Q62191 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim21Q62191 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim21Q62191 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim21Q62191 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim21Q62191 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim21Q62191 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim21Q62191 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim21Q62191 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim21Q62191 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim21Q62191 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim21Q62191 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim21Q62191 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim21Q62191 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim21Q62191 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim21Q62191 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim21Q62191 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim21Q62191 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim21Q62191 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim21Q62191 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim21Q62191 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim21Q62191 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim21Q62191 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim21Q62191 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim21Q62191 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim21Q62191 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim21Q62191 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim21Q62191 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim21Q62191 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim21Q62191 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim21Q62191 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim21Q62191 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim21Q62191 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim21Q62191 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim21Q62191 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim21Q62191 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim21Q62191 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim21Q62191 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim21Q62191 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim21Q62191 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim21Q62191 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim21Q62191 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim21Q62191 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim21Q62191 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim21Q62191 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim21Q62191 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim21Q62191 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim21Q62191 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim21Q62191 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim21Q62191 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim21Q62191 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim21Q62191 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim21Q62191 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim21Q62191 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim21Q62191 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim21Q62191 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim21Q62191 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim21Q62191 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim21Q62191 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim21Q62191 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim21Q62191 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim21Q62191 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim21Q62191 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim21Q62191 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim21Q62191 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim21Q62191 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim21Q62191 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim21Q62191 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim21Q62191 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim21Q62191 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim21Q62191 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trim21Q62191 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim21Q62191 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim21Q62191 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim21Q62191 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim21Q62191 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim21Q62191 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim21Q62191 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim21Q62191 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim21Q62191 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim21Q62191 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim21Q62191 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim21Q62191 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim21Q62191 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim21Q62191 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim21Q62191 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim21Q62191 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim21Q62191 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim21Q62191 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim21Q62191 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim21Q62191 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim21Q62191 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim21Q62191 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim21Q62191 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim21Q62191 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim21Q62191 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim21Q62191 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim21Q62191 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim21Q62191 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms