Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Odf1Q61999 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Odf1Q61999 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Odf1Q61999 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Odf1Q61999 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Odf1Q61999 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Odf1Q61999 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Odf1Q61999 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Odf1Q61999 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Odf1Q61999 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Odf1Q61999 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Odf1Q61999 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Odf1Q61999 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Odf1Q61999 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Odf1Q61999 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Odf1Q61999 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Odf1Q61999 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Odf1Q61999 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Odf1Q61999 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Odf1Q61999 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Odf1Q61999 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Odf1Q61999 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Odf1Q61999 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Odf1Q61999 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Odf1Q61999 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Odf1Q61999 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Odf1Q61999 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Odf1Q61999 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf1Q61999 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf1Q61999 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf1Q61999 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf1Q61999 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Odf1Q61999 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Odf1Q61999 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Odf1Q61999 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Odf1Q61999 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Odf1Q61999 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Odf1Q61999 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Odf1Q61999 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Odf1Q61999 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Odf1Q61999 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Odf1Q61999 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Odf1Q61999 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Odf1Q61999 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Odf1Q61999 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Odf1Q61999 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Odf1Q61999 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Odf1Q61999 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Odf1Q61999 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Odf1Q61999 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Odf1Q61999 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Odf1Q61999 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Odf1Q61999 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Odf1Q61999 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Odf1Q61999 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf1Q61999 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf1Q61999 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf1Q61999 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Odf1Q61999 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Odf1Q61999 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Odf1Q61999 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Odf1Q61999 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Odf1Q61999 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Odf1Q61999 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Odf1Q61999 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Odf1Q61999 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Odf1Q61999 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Odf1Q61999 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Odf1Q61999 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Odf1Q61999 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Odf1Q61999 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Odf1Q61999 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Odf1Q61999 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Odf1Q61999 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Odf1Q61999 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Odf1Q61999 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Odf1Q61999 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Odf1Q61999 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Odf1Q61999 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Odf1Q61999 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Odf1Q61999 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Odf1Q61999 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Odf1Q61999 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Odf1Q61999 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Odf1Q61999 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Odf1Q61999 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Odf1Q61999 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Odf1Q61999 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Odf1Q61999 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Odf1Q61999 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Odf1Q61999 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Odf1Q61999 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Odf1Q61999 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Odf1Q61999 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Odf1Q61999 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Odf1Q61999 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Odf1Q61999 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Odf1Q61999 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Odf1Q61999 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Odf1Q61999 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms