Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Foxd1Q61345 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Foxd1Q61345 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Foxd1Q61345 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Foxd1Q61345 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Foxd1Q61345 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Foxd1Q61345 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Foxd1Q61345 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Foxd1Q61345 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Foxd1Q61345 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Foxd1Q61345 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Foxd1Q61345 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Foxd1Q61345 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Foxd1Q61345 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Foxd1Q61345 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Foxd1Q61345 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Foxd1Q61345 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Foxd1Q61345 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Foxd1Q61345 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Foxd1Q61345 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Foxd1Q61345 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Foxd1Q61345 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Foxd1Q61345 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Foxd1Q61345 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Foxd1Q61345 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Foxd1Q61345 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Foxd1Q61345 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Foxd1Q61345 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Foxd1Q61345 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Foxd1Q61345 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Foxd1Q61345 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Foxd1Q61345 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Foxd1Q61345 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Foxd1Q61345 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Foxd1Q61345 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Foxd1Q61345 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Foxd1Q61345 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Foxd1Q61345 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Foxd1Q61345 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Foxd1Q61345 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Foxd1Q61345 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Foxd1Q61345 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Foxd1Q61345 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Foxd1Q61345 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Foxd1Q61345 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Foxd1Q61345 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Foxd1Q61345 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Foxd1Q61345 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Foxd1Q61345 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Foxd1Q61345 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Foxd1Q61345 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Foxd1Q61345 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Foxd1Q61345 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Foxd1Q61345 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Foxd1Q61345 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Foxd1Q61345 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Foxd1Q61345 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Foxd1Q61345 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Foxd1Q61345 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Foxd1Q61345 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Foxd1Q61345 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Foxd1Q61345 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Foxd1Q61345 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Foxd1Q61345 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Foxd1Q61345 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Foxd1Q61345 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Foxd1Q61345 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Foxd1Q61345 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Foxd1Q61345 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Foxd1Q61345 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Foxd1Q61345 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Foxd1Q61345 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Foxd1Q61345 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Foxd1Q61345 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Foxd1Q61345 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Foxd1Q61345 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Foxd1Q61345 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Foxd1Q61345 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Foxd1Q61345 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Foxd1Q61345 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Foxd1Q61345 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Foxd1Q61345 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Foxd1Q61345 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Foxd1Q61345 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Foxd1Q61345 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Foxd1Q61345 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Foxd1Q61345 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Foxd1Q61345 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Foxd1Q61345 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Foxd1Q61345 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Foxd1Q61345 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Foxd1Q61345 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Foxd1Q61345 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Foxd1Q61345 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Foxd1Q61345 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Foxd1Q61345 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Foxd1Q61345 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Foxd1Q61345 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Foxd1Q61345 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Foxd1Q61345 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms