Protein–RNA interactions for Protein: Q61143

Trpc6, Short transient receptor potential channel 6, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc6Q61143 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trpc6Q61143 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trpc6Q61143 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trpc6Q61143 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trpc6Q61143 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Trpc6Q61143 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trpc6Q61143 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trpc6Q61143 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trpc6Q61143 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trpc6Q61143 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Trpc6Q61143 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trpc6Q61143 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trpc6Q61143 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trpc6Q61143 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trpc6Q61143 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trpc6Q61143 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trpc6Q61143 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trpc6Q61143 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trpc6Q61143 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Trpc6Q61143 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trpc6Q61143 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trpc6Q61143 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trpc6Q61143 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trpc6Q61143 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trpc6Q61143 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trpc6Q61143 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trpc6Q61143 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trpc6Q61143 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trpc6Q61143 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpc6Q61143 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpc6Q61143 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpc6Q61143 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpc6Q61143 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpc6Q61143 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trpc6Q61143 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trpc6Q61143 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trpc6Q61143 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trpc6Q61143 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trpc6Q61143 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpc6Q61143 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpc6Q61143 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpc6Q61143 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpc6Q61143 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpc6Q61143 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpc6Q61143 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpc6Q61143 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpc6Q61143 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpc6Q61143 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpc6Q61143 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpc6Q61143 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpc6Q61143 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpc6Q61143 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trpc6Q61143 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpc6Q61143 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpc6Q61143 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpc6Q61143 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Trpc6Q61143 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpc6Q61143 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpc6Q61143 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpc6Q61143 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trpc6Q61143 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trpc6Q61143 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Trpc6Q61143 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trpc6Q61143 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trpc6Q61143 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trpc6Q61143 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trpc6Q61143 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trpc6Q61143 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trpc6Q61143 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpc6Q61143 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpc6Q61143 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpc6Q61143 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpc6Q61143 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpc6Q61143 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpc6Q61143 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpc6Q61143 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpc6Q61143 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trpc6Q61143 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trpc6Q61143 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trpc6Q61143 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trpc6Q61143 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trpc6Q61143 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trpc6Q61143 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trpc6Q61143 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trpc6Q61143 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trpc6Q61143 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trpc6Q61143 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trpc6Q61143 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trpc6Q61143 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trpc6Q61143 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trpc6Q61143 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trpc6Q61143 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Trpc6Q61143 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trpc6Q61143 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpc6Q61143 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpc6Q61143 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpc6Q61143 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpc6Q61143 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpc6Q61143 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trpc6Q61143 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms