Protein–RNA interactions for Protein: Q60680

Chuk, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChukQ60680 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ChukQ60680 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ChukQ60680 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ChukQ60680 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ChukQ60680 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ChukQ60680 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ChukQ60680 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ChukQ60680 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ChukQ60680 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ChukQ60680 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ChukQ60680 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ChukQ60680 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ChukQ60680 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ChukQ60680 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ChukQ60680 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ChukQ60680 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ChukQ60680 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ChukQ60680 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ChukQ60680 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ChukQ60680 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ChukQ60680 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ChukQ60680 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ChukQ60680 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ChukQ60680 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ChukQ60680 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ChukQ60680 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ChukQ60680 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ChukQ60680 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ChukQ60680 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ChukQ60680 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ChukQ60680 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ChukQ60680 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ChukQ60680 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ChukQ60680 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ChukQ60680 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ChukQ60680 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ChukQ60680 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ChukQ60680 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ChukQ60680 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ChukQ60680 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ChukQ60680 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ChukQ60680 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ChukQ60680 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ChukQ60680 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ChukQ60680 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ChukQ60680 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ChukQ60680 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ChukQ60680 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ChukQ60680 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ChukQ60680 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ChukQ60680 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ChukQ60680 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ChukQ60680 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ChukQ60680 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ChukQ60680 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ChukQ60680 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ChukQ60680 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ChukQ60680 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ChukQ60680 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ChukQ60680 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ChukQ60680 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ChukQ60680 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ChukQ60680 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ChukQ60680 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ChukQ60680 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ChukQ60680 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ChukQ60680 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ChukQ60680 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ChukQ60680 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ChukQ60680 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ChukQ60680 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ChukQ60680 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ChukQ60680 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ChukQ60680 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ChukQ60680 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ChukQ60680 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ChukQ60680 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ChukQ60680 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ChukQ60680 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ChukQ60680 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ChukQ60680 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ChukQ60680 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ChukQ60680 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ChukQ60680 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ChukQ60680 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ChukQ60680 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ChukQ60680 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ChukQ60680 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ChukQ60680 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ChukQ60680 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ChukQ60680 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ChukQ60680 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ChukQ60680 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ChukQ60680 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ChukQ60680 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ChukQ60680 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ChukQ60680 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ChukQ60680 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ChukQ60680 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ChukQ60680 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms