Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Bbs12Q5SUD9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bbs12Q5SUD9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bbs12Q5SUD9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bbs12Q5SUD9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bbs12Q5SUD9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bbs12Q5SUD9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bbs12Q5SUD9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bbs12Q5SUD9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Bbs12Q5SUD9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bbs12Q5SUD9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bbs12Q5SUD9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Bbs12Q5SUD9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bbs12Q5SUD9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bbs12Q5SUD9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bbs12Q5SUD9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bbs12Q5SUD9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bbs12Q5SUD9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bbs12Q5SUD9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bbs12Q5SUD9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Bbs12Q5SUD9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Bbs12Q5SUD9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bbs12Q5SUD9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bbs12Q5SUD9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bbs12Q5SUD9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bbs12Q5SUD9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bbs12Q5SUD9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bbs12Q5SUD9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bbs12Q5SUD9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bbs12Q5SUD9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bbs12Q5SUD9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Bbs12Q5SUD9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Bbs12Q5SUD9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Bbs12Q5SUD9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bbs12Q5SUD9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bbs12Q5SUD9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bbs12Q5SUD9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bbs12Q5SUD9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bbs12Q5SUD9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bbs12Q5SUD9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bbs12Q5SUD9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bbs12Q5SUD9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Bbs12Q5SUD9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bbs12Q5SUD9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bbs12Q5SUD9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bbs12Q5SUD9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Bbs12Q5SUD9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bbs12Q5SUD9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bbs12Q5SUD9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bbs12Q5SUD9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bbs12Q5SUD9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bbs12Q5SUD9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bbs12Q5SUD9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bbs12Q5SUD9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bbs12Q5SUD9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Bbs12Q5SUD9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bbs12Q5SUD9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bbs12Q5SUD9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bbs12Q5SUD9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bbs12Q5SUD9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bbs12Q5SUD9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bbs12Q5SUD9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bbs12Q5SUD9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bbs12Q5SUD9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bbs12Q5SUD9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bbs12Q5SUD9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bbs12Q5SUD9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bbs12Q5SUD9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bbs12Q5SUD9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bbs12Q5SUD9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bbs12Q5SUD9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bbs12Q5SUD9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Bbs12Q5SUD9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bbs12Q5SUD9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bbs12Q5SUD9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bbs12Q5SUD9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bbs12Q5SUD9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bbs12Q5SUD9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bbs12Q5SUD9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bbs12Q5SUD9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bbs12Q5SUD9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Bbs12Q5SUD9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bbs12Q5SUD9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Bbs12Q5SUD9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bbs12Q5SUD9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bbs12Q5SUD9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bbs12Q5SUD9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bbs12Q5SUD9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bbs12Q5SUD9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bbs12Q5SUD9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bbs12Q5SUD9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bbs12Q5SUD9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bbs12Q5SUD9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bbs12Q5SUD9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bbs12Q5SUD9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bbs12Q5SUD9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bbs12Q5SUD9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bbs12Q5SUD9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bbs12Q5SUD9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bbs12Q5SUD9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.5 ms