Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1I8

Trav3-1, T cell receptor alpha variable 3-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav3-1Q5R1I8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav3-1Q5R1I8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trav3-1Q5R1I8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trav3-1Q5R1I8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trav3-1Q5R1I8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trav3-1Q5R1I8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trav3-1Q5R1I8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav3-1Q5R1I8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav3-1Q5R1I8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav3-1Q5R1I8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav3-1Q5R1I8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav3-1Q5R1I8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav3-1Q5R1I8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav3-1Q5R1I8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trav3-1Q5R1I8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav3-1Q5R1I8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav3-1Q5R1I8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav3-1Q5R1I8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav3-1Q5R1I8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav3-1Q5R1I8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav3-1Q5R1I8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav3-1Q5R1I8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav3-1Q5R1I8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav3-1Q5R1I8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav3-1Q5R1I8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav3-1Q5R1I8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trav3-1Q5R1I8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav3-1Q5R1I8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav3-1Q5R1I8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav3-1Q5R1I8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav3-1Q5R1I8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav3-1Q5R1I8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav3-1Q5R1I8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trav3-1Q5R1I8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav3-1Q5R1I8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav3-1Q5R1I8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav3-1Q5R1I8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav3-1Q5R1I8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav3-1Q5R1I8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav3-1Q5R1I8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav3-1Q5R1I8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav3-1Q5R1I8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav3-1Q5R1I8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav3-1Q5R1I8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav3-1Q5R1I8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav3-1Q5R1I8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav3-1Q5R1I8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav3-1Q5R1I8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trav3-1Q5R1I8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trav3-1Q5R1I8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trav3-1Q5R1I8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trav3-1Q5R1I8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trav3-1Q5R1I8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trav3-1Q5R1I8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trav3-1Q5R1I8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trav3-1Q5R1I8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav3-1Q5R1I8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav3-1Q5R1I8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav3-1Q5R1I8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav3-1Q5R1I8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav3-1Q5R1I8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav3-1Q5R1I8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav3-1Q5R1I8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav3-1Q5R1I8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav3-1Q5R1I8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav3-1Q5R1I8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav3-1Q5R1I8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav3-1Q5R1I8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav3-1Q5R1I8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav3-1Q5R1I8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav3-1Q5R1I8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav3-1Q5R1I8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav3-1Q5R1I8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav3-1Q5R1I8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav3-1Q5R1I8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav3-1Q5R1I8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav3-1Q5R1I8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav3-1Q5R1I8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav3-1Q5R1I8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav3-1Q5R1I8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav3-1Q5R1I8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav3-1Q5R1I8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav3-1Q5R1I8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav3-1Q5R1I8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav3-1Q5R1I8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav3-1Q5R1I8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav3-1Q5R1I8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav3-1Q5R1I8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav3-1Q5R1I8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav3-1Q5R1I8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav3-1Q5R1I8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav3-1Q5R1I8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav3-1Q5R1I8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav3-1Q5R1I8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav3-1Q5R1I8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav3-1Q5R1I8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav3-1Q5R1I8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav3-1Q5R1I8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav3-1Q5R1I8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav3-1Q5R1I8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms