Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc1Q5NCF2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc1Q5NCF2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc1Q5NCF2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc1Q5NCF2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc1Q5NCF2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc1Q5NCF2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc1Q5NCF2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc1Q5NCF2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc1Q5NCF2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc1Q5NCF2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc1Q5NCF2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc1Q5NCF2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc1Q5NCF2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc1Q5NCF2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc1Q5NCF2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc1Q5NCF2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc1Q5NCF2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc1Q5NCF2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc1Q5NCF2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc1Q5NCF2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc1Q5NCF2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc1Q5NCF2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc1Q5NCF2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc1Q5NCF2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc1Q5NCF2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc1Q5NCF2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trappc1Q5NCF2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trappc1Q5NCF2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc1Q5NCF2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc1Q5NCF2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc1Q5NCF2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc1Q5NCF2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc1Q5NCF2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc1Q5NCF2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc1Q5NCF2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc1Q5NCF2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc1Q5NCF2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc1Q5NCF2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc1Q5NCF2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc1Q5NCF2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc1Q5NCF2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc1Q5NCF2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc1Q5NCF2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc1Q5NCF2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc1Q5NCF2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc1Q5NCF2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc1Q5NCF2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc1Q5NCF2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc1Q5NCF2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc1Q5NCF2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc1Q5NCF2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc1Q5NCF2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc1Q5NCF2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc1Q5NCF2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc1Q5NCF2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc1Q5NCF2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc1Q5NCF2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc1Q5NCF2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc1Q5NCF2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc1Q5NCF2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc1Q5NCF2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc1Q5NCF2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc1Q5NCF2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc1Q5NCF2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc1Q5NCF2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc1Q5NCF2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc1Q5NCF2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc1Q5NCF2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc1Q5NCF2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc1Q5NCF2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc1Q5NCF2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc1Q5NCF2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc1Q5NCF2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc1Q5NCF2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc1Q5NCF2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc1Q5NCF2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc1Q5NCF2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc1Q5NCF2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc1Q5NCF2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc1Q5NCF2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc1Q5NCF2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc1Q5NCF2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc1Q5NCF2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc1Q5NCF2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc1Q5NCF2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc1Q5NCF2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc1Q5NCF2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc1Q5NCF2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc1Q5NCF2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc1Q5NCF2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc1Q5NCF2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc1Q5NCF2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc1Q5NCF2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc1Q5NCF2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc1Q5NCF2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc1Q5NCF2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc1Q5NCF2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc1Q5NCF2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc1Q5NCF2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms