Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
Trim41Q5NCC3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Trim41Q5NCC3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Trim41Q5NCC3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC40.23■■■■■ 4.03
Trim41Q5NCC3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Trim41Q5NCC3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Trim41Q5NCC3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
Trim41Q5NCC3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Trim41Q5NCC3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Trim41Q5NCC3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Trim41Q5NCC3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
Trim41Q5NCC3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Trim41Q5NCC3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Trim41Q5NCC3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
Trim41Q5NCC3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Trim41Q5NCC3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
Trim41Q5NCC3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
Trim41Q5NCC3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC40.17■■■■■ 4.02
Trim41Q5NCC3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Trim41Q5NCC3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
Trim41Q5NCC3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Trim41Q5NCC3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Trim41Q5NCC3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Trim41Q5NCC3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
Trim41Q5NCC3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
Trim41Q5NCC3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
Trim41Q5NCC3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.02
Trim41Q5NCC3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC40.12■■■■■ 4.01
Trim41Q5NCC3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
Trim41Q5NCC3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
Trim41Q5NCC3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC40.1■■■■■ 4.01
Trim41Q5NCC3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
Trim41Q5NCC3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC40.1■■■■■ 4.01
Trim41Q5NCC3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Trim41Q5NCC3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
Trim41Q5NCC3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Trim41Q5NCC3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Trim41Q5NCC3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Trim41Q5NCC3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4
Trim41Q5NCC3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC40.06■■■■■ 4
Trim41Q5NCC3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
Trim41Q5NCC3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Trim41Q5NCC3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Trim41Q5NCC3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Trim41Q5NCC3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Trim41Q5NCC3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Trim41Q5NCC3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC40.03■■■■■ 4
Trim41Q5NCC3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC40.03■■■■■ 4
Trim41Q5NCC3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC40.03■■■■■ 4
Trim41Q5NCC3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Trim41Q5NCC3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
Trim41Q5NCC3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Trim41Q5NCC3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
Trim41Q5NCC3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
Trim41Q5NCC3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC40.01■■■■■ 4
Trim41Q5NCC3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
Trim41Q5NCC3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Trim41Q5NCC3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Trim41Q5NCC3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Trim41Q5NCC3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
Trim41Q5NCC3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC39.98■■■■□ 3.99
Trim41Q5NCC3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
Trim41Q5NCC3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Trim41Q5NCC3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Trim41Q5NCC3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Trim41Q5NCC3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC39.95■■■■□ 3.99
Trim41Q5NCC3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Trim41Q5NCC3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC39.94■■■■□ 3.98
Trim41Q5NCC3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
Trim41Q5NCC3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
Trim41Q5NCC3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
Trim41Q5NCC3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Trim41Q5NCC3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC39.92■■■■□ 3.98
Trim41Q5NCC3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Trim41Q5NCC3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Trim41Q5NCC3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Trim41Q5NCC3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Trim41Q5NCC3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Trim41Q5NCC3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Trim41Q5NCC3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
Trim41Q5NCC3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Trim41Q5NCC3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
Trim41Q5NCC3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.97
Trim41Q5NCC3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
Trim41Q5NCC3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
Trim41Q5NCC3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC39.86■■■■□ 3.97
Trim41Q5NCC3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Trim41Q5NCC3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Trim41Q5NCC3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Trim41Q5NCC3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Trim41Q5NCC3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Trim41Q5NCC3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
Trim41Q5NCC3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
Trim41Q5NCC3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Trim41Q5NCC3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
Trim41Q5NCC3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
Trim41Q5NCC3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC39.78■■■■□ 3.96
Trim41Q5NCC3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Trim41Q5NCC3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.77■■■■□ 3.96
Trim41Q5NCC3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC39.77■■■■□ 3.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109 ms