Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Syne3Q4FZC9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Syne3Q4FZC9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Syne3Q4FZC9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Syne3Q4FZC9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Syne3Q4FZC9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Syne3Q4FZC9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Syne3Q4FZC9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Syne3Q4FZC9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Syne3Q4FZC9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Syne3Q4FZC9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Syne3Q4FZC9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Syne3Q4FZC9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Syne3Q4FZC9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Syne3Q4FZC9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syne3Q4FZC9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syne3Q4FZC9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syne3Q4FZC9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syne3Q4FZC9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Syne3Q4FZC9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Syne3Q4FZC9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Syne3Q4FZC9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Syne3Q4FZC9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Syne3Q4FZC9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Syne3Q4FZC9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Syne3Q4FZC9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Syne3Q4FZC9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Syne3Q4FZC9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Syne3Q4FZC9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Syne3Q4FZC9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Syne3Q4FZC9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Syne3Q4FZC9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syne3Q4FZC9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syne3Q4FZC9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syne3Q4FZC9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syne3Q4FZC9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syne3Q4FZC9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syne3Q4FZC9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syne3Q4FZC9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syne3Q4FZC9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syne3Q4FZC9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syne3Q4FZC9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syne3Q4FZC9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Syne3Q4FZC9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Syne3Q4FZC9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Syne3Q4FZC9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Syne3Q4FZC9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Syne3Q4FZC9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Syne3Q4FZC9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Syne3Q4FZC9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Syne3Q4FZC9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Syne3Q4FZC9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Syne3Q4FZC9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Syne3Q4FZC9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syne3Q4FZC9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syne3Q4FZC9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syne3Q4FZC9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syne3Q4FZC9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syne3Q4FZC9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syne3Q4FZC9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syne3Q4FZC9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Syne3Q4FZC9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Syne3Q4FZC9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Syne3Q4FZC9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Syne3Q4FZC9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Syne3Q4FZC9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Syne3Q4FZC9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Syne3Q4FZC9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Syne3Q4FZC9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Syne3Q4FZC9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Syne3Q4FZC9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syne3Q4FZC9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syne3Q4FZC9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Syne3Q4FZC9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Syne3Q4FZC9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Syne3Q4FZC9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Syne3Q4FZC9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Syne3Q4FZC9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Syne3Q4FZC9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Syne3Q4FZC9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Syne3Q4FZC9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Syne3Q4FZC9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Syne3Q4FZC9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Syne3Q4FZC9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Syne3Q4FZC9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Syne3Q4FZC9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Syne3Q4FZC9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Syne3Q4FZC9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syne3Q4FZC9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syne3Q4FZC9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syne3Q4FZC9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Syne3Q4FZC9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Syne3Q4FZC9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Syne3Q4FZC9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Syne3Q4FZC9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Syne3Q4FZC9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Syne3Q4FZC9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Syne3Q4FZC9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Syne3Q4FZC9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Syne3Q4FZC9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms