Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1D5

Pnpla1, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpla1Q3V1D5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pnpla1Q3V1D5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pnpla1Q3V1D5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pnpla1Q3V1D5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pnpla1Q3V1D5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pnpla1Q3V1D5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pnpla1Q3V1D5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pnpla1Q3V1D5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pnpla1Q3V1D5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnpla1Q3V1D5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnpla1Q3V1D5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnpla1Q3V1D5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnpla1Q3V1D5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnpla1Q3V1D5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnpla1Q3V1D5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnpla1Q3V1D5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnpla1Q3V1D5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnpla1Q3V1D5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pnpla1Q3V1D5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pnpla1Q3V1D5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pnpla1Q3V1D5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pnpla1Q3V1D5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnpla1Q3V1D5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnpla1Q3V1D5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnpla1Q3V1D5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnpla1Q3V1D5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pnpla1Q3V1D5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pnpla1Q3V1D5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pnpla1Q3V1D5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pnpla1Q3V1D5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pnpla1Q3V1D5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pnpla1Q3V1D5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pnpla1Q3V1D5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pnpla1Q3V1D5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pnpla1Q3V1D5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pnpla1Q3V1D5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pnpla1Q3V1D5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pnpla1Q3V1D5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pnpla1Q3V1D5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pnpla1Q3V1D5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pnpla1Q3V1D5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pnpla1Q3V1D5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pnpla1Q3V1D5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pnpla1Q3V1D5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pnpla1Q3V1D5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pnpla1Q3V1D5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pnpla1Q3V1D5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pnpla1Q3V1D5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pnpla1Q3V1D5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pnpla1Q3V1D5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pnpla1Q3V1D5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pnpla1Q3V1D5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pnpla1Q3V1D5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pnpla1Q3V1D5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pnpla1Q3V1D5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pnpla1Q3V1D5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pnpla1Q3V1D5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pnpla1Q3V1D5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pnpla1Q3V1D5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pnpla1Q3V1D5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pnpla1Q3V1D5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pnpla1Q3V1D5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pnpla1Q3V1D5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pnpla1Q3V1D5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pnpla1Q3V1D5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pnpla1Q3V1D5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pnpla1Q3V1D5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pnpla1Q3V1D5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pnpla1Q3V1D5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Pnpla1Q3V1D5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Pnpla1Q3V1D5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pnpla1Q3V1D5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pnpla1Q3V1D5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pnpla1Q3V1D5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pnpla1Q3V1D5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Pnpla1Q3V1D5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pnpla1Q3V1D5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pnpla1Q3V1D5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pnpla1Q3V1D5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pnpla1Q3V1D5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pnpla1Q3V1D5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pnpla1Q3V1D5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pnpla1Q3V1D5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pnpla1Q3V1D5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pnpla1Q3V1D5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pnpla1Q3V1D5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pnpla1Q3V1D5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pnpla1Q3V1D5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pnpla1Q3V1D5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pnpla1Q3V1D5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pnpla1Q3V1D5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Pnpla1Q3V1D5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Pnpla1Q3V1D5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pnpla1Q3V1D5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pnpla1Q3V1D5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pnpla1Q3V1D5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pnpla1Q3V1D5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pnpla1Q3V1D5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pnpla1Q3V1D5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pnpla1Q3V1D5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms