Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ulk4Q3V129 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ulk4Q3V129 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ulk4Q3V129 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ulk4Q3V129 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ulk4Q3V129 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ulk4Q3V129 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ulk4Q3V129 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ulk4Q3V129 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ulk4Q3V129 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ulk4Q3V129 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ulk4Q3V129 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ulk4Q3V129 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ulk4Q3V129 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ulk4Q3V129 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ulk4Q3V129 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ulk4Q3V129 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ulk4Q3V129 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ulk4Q3V129 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ulk4Q3V129 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ulk4Q3V129 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ulk4Q3V129 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ulk4Q3V129 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ulk4Q3V129 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Ulk4Q3V129 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ulk4Q3V129 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Ulk4Q3V129 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ulk4Q3V129 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ulk4Q3V129 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ulk4Q3V129 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ulk4Q3V129 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ulk4Q3V129 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ulk4Q3V129 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ulk4Q3V129 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ulk4Q3V129 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ulk4Q3V129 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ulk4Q3V129 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ulk4Q3V129 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ulk4Q3V129 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ulk4Q3V129 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ulk4Q3V129 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ulk4Q3V129 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ulk4Q3V129 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ulk4Q3V129 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Ulk4Q3V129 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ulk4Q3V129 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ulk4Q3V129 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ulk4Q3V129 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ulk4Q3V129 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ulk4Q3V129 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Ulk4Q3V129 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ulk4Q3V129 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ulk4Q3V129 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ulk4Q3V129 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ulk4Q3V129 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ulk4Q3V129 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ulk4Q3V129 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ulk4Q3V129 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ulk4Q3V129 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ulk4Q3V129 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ulk4Q3V129 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ulk4Q3V129 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ulk4Q3V129 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ulk4Q3V129 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ulk4Q3V129 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ulk4Q3V129 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ulk4Q3V129 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ulk4Q3V129 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ulk4Q3V129 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ulk4Q3V129 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ulk4Q3V129 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ulk4Q3V129 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ulk4Q3V129 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ulk4Q3V129 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ulk4Q3V129 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ulk4Q3V129 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ulk4Q3V129 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ulk4Q3V129 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ulk4Q3V129 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ulk4Q3V129 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ulk4Q3V129 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ulk4Q3V129 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ulk4Q3V129 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ulk4Q3V129 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ulk4Q3V129 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Ulk4Q3V129 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ulk4Q3V129 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ulk4Q3V129 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ulk4Q3V129 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ulk4Q3V129 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ulk4Q3V129 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ulk4Q3V129 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ulk4Q3V129 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ulk4Q3V129 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ulk4Q3V129 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ulk4Q3V129 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ulk4Q3V129 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ulk4Q3V129 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Ulk4Q3V129 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ulk4Q3V129 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms