Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cln5Q3UMW8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cln5Q3UMW8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cln5Q3UMW8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cln5Q3UMW8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cln5Q3UMW8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cln5Q3UMW8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cln5Q3UMW8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cln5Q3UMW8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cln5Q3UMW8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cln5Q3UMW8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cln5Q3UMW8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cln5Q3UMW8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cln5Q3UMW8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Cln5Q3UMW8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Cln5Q3UMW8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cln5Q3UMW8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cln5Q3UMW8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cln5Q3UMW8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cln5Q3UMW8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cln5Q3UMW8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cln5Q3UMW8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cln5Q3UMW8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cln5Q3UMW8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cln5Q3UMW8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cln5Q3UMW8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cln5Q3UMW8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cln5Q3UMW8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cln5Q3UMW8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cln5Q3UMW8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cln5Q3UMW8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cln5Q3UMW8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cln5Q3UMW8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cln5Q3UMW8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cln5Q3UMW8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cln5Q3UMW8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Cln5Q3UMW8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cln5Q3UMW8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cln5Q3UMW8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cln5Q3UMW8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cln5Q3UMW8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cln5Q3UMW8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cln5Q3UMW8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cln5Q3UMW8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Cln5Q3UMW8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Cln5Q3UMW8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cln5Q3UMW8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cln5Q3UMW8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cln5Q3UMW8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cln5Q3UMW8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cln5Q3UMW8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cln5Q3UMW8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cln5Q3UMW8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cln5Q3UMW8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cln5Q3UMW8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cln5Q3UMW8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cln5Q3UMW8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cln5Q3UMW8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cln5Q3UMW8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cln5Q3UMW8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cln5Q3UMW8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cln5Q3UMW8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cln5Q3UMW8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cln5Q3UMW8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cln5Q3UMW8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cln5Q3UMW8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cln5Q3UMW8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cln5Q3UMW8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cln5Q3UMW8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cln5Q3UMW8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cln5Q3UMW8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cln5Q3UMW8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Cln5Q3UMW8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cln5Q3UMW8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cln5Q3UMW8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cln5Q3UMW8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cln5Q3UMW8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cln5Q3UMW8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cln5Q3UMW8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cln5Q3UMW8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cln5Q3UMW8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cln5Q3UMW8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Cln5Q3UMW8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Cln5Q3UMW8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cln5Q3UMW8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cln5Q3UMW8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cln5Q3UMW8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cln5Q3UMW8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cln5Q3UMW8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cln5Q3UMW8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cln5Q3UMW8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Cln5Q3UMW8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cln5Q3UMW8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cln5Q3UMW8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cln5Q3UMW8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cln5Q3UMW8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cln5Q3UMW8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cln5Q3UMW8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cln5Q3UMW8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cln5Q3UMW8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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