Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMR0

Ankrd27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd27Q3UMR0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ankrd27Q3UMR0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ankrd27Q3UMR0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ankrd27Q3UMR0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ankrd27Q3UMR0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ankrd27Q3UMR0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ankrd27Q3UMR0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ankrd27Q3UMR0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ankrd27Q3UMR0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ankrd27Q3UMR0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ankrd27Q3UMR0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ankrd27Q3UMR0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ankrd27Q3UMR0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ankrd27Q3UMR0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ankrd27Q3UMR0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ankrd27Q3UMR0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ankrd27Q3UMR0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ankrd27Q3UMR0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ankrd27Q3UMR0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ankrd27Q3UMR0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ankrd27Q3UMR0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ankrd27Q3UMR0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ankrd27Q3UMR0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ankrd27Q3UMR0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ankrd27Q3UMR0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ankrd27Q3UMR0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ankrd27Q3UMR0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ankrd27Q3UMR0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ankrd27Q3UMR0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ankrd27Q3UMR0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ankrd27Q3UMR0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ankrd27Q3UMR0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ankrd27Q3UMR0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ankrd27Q3UMR0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ankrd27Q3UMR0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ankrd27Q3UMR0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ankrd27Q3UMR0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ankrd27Q3UMR0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ankrd27Q3UMR0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ankrd27Q3UMR0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ankrd27Q3UMR0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ankrd27Q3UMR0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ankrd27Q3UMR0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ankrd27Q3UMR0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ankrd27Q3UMR0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ankrd27Q3UMR0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ankrd27Q3UMR0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ankrd27Q3UMR0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ankrd27Q3UMR0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ankrd27Q3UMR0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ankrd27Q3UMR0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ankrd27Q3UMR0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ankrd27Q3UMR0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ankrd27Q3UMR0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ankrd27Q3UMR0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ankrd27Q3UMR0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ankrd27Q3UMR0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ankrd27Q3UMR0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ankrd27Q3UMR0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ankrd27Q3UMR0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd27Q3UMR0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd27Q3UMR0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd27Q3UMR0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd27Q3UMR0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ankrd27Q3UMR0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ankrd27Q3UMR0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ankrd27Q3UMR0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ankrd27Q3UMR0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ankrd27Q3UMR0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ankrd27Q3UMR0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ankrd27Q3UMR0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ankrd27Q3UMR0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ankrd27Q3UMR0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ankrd27Q3UMR0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ankrd27Q3UMR0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ankrd27Q3UMR0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ankrd27Q3UMR0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ankrd27Q3UMR0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ankrd27Q3UMR0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ankrd27Q3UMR0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ankrd27Q3UMR0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ankrd27Q3UMR0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ankrd27Q3UMR0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ankrd27Q3UMR0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ankrd27Q3UMR0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ankrd27Q3UMR0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ankrd27Q3UMR0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ankrd27Q3UMR0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ankrd27Q3UMR0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ankrd27Q3UMR0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ankrd27Q3UMR0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ankrd27Q3UMR0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ankrd27Q3UMR0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ankrd27Q3UMR0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ankrd27Q3UMR0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ankrd27Q3UMR0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ankrd27Q3UMR0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ankrd27Q3UMR0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ankrd27Q3UMR0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ankrd27Q3UMR0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms