Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Parp8Q3UD82 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Parp8Q3UD82 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Parp8Q3UD82 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Parp8Q3UD82 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Parp8Q3UD82 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Parp8Q3UD82 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Parp8Q3UD82 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Parp8Q3UD82 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Parp8Q3UD82 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Parp8Q3UD82 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Parp8Q3UD82 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Parp8Q3UD82 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Parp8Q3UD82 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Parp8Q3UD82 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Parp8Q3UD82 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Parp8Q3UD82 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Parp8Q3UD82 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Parp8Q3UD82 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Parp8Q3UD82 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Parp8Q3UD82 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Parp8Q3UD82 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Parp8Q3UD82 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Parp8Q3UD82 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Parp8Q3UD82 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Parp8Q3UD82 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Parp8Q3UD82 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Parp8Q3UD82 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Parp8Q3UD82 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Parp8Q3UD82 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Parp8Q3UD82 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Parp8Q3UD82 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Parp8Q3UD82 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Parp8Q3UD82 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Parp8Q3UD82 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Parp8Q3UD82 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Parp8Q3UD82 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Parp8Q3UD82 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Parp8Q3UD82 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Parp8Q3UD82 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Parp8Q3UD82 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Parp8Q3UD82 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Parp8Q3UD82 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Parp8Q3UD82 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Parp8Q3UD82 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Parp8Q3UD82 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Parp8Q3UD82 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Parp8Q3UD82 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Parp8Q3UD82 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Parp8Q3UD82 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Parp8Q3UD82 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Parp8Q3UD82 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Parp8Q3UD82 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Parp8Q3UD82 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Parp8Q3UD82 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Parp8Q3UD82 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Parp8Q3UD82 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Parp8Q3UD82 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Parp8Q3UD82 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Parp8Q3UD82 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Parp8Q3UD82 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Parp8Q3UD82 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Parp8Q3UD82 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Parp8Q3UD82 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Parp8Q3UD82 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Parp8Q3UD82 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Parp8Q3UD82 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Parp8Q3UD82 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Parp8Q3UD82 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Parp8Q3UD82 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Parp8Q3UD82 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Parp8Q3UD82 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Parp8Q3UD82 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Parp8Q3UD82 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Parp8Q3UD82 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Parp8Q3UD82 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Parp8Q3UD82 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Parp8Q3UD82 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Parp8Q3UD82 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Parp8Q3UD82 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Parp8Q3UD82 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Parp8Q3UD82 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Parp8Q3UD82 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Parp8Q3UD82 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Parp8Q3UD82 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Parp8Q3UD82 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Parp8Q3UD82 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Parp8Q3UD82 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Parp8Q3UD82 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Parp8Q3UD82 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Parp8Q3UD82 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Parp8Q3UD82 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Parp8Q3UD82 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Parp8Q3UD82 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Parp8Q3UD82 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Parp8Q3UD82 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Parp8Q3UD82 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Parp8Q3UD82 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Parp8Q3UD82 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Parp8Q3UD82 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms