Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ulk3Q3U3Q1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ulk3Q3U3Q1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ulk3Q3U3Q1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ulk3Q3U3Q1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ulk3Q3U3Q1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ulk3Q3U3Q1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ulk3Q3U3Q1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ulk3Q3U3Q1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ulk3Q3U3Q1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ulk3Q3U3Q1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ulk3Q3U3Q1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ulk3Q3U3Q1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ulk3Q3U3Q1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ulk3Q3U3Q1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ulk3Q3U3Q1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ulk3Q3U3Q1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ulk3Q3U3Q1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ulk3Q3U3Q1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ulk3Q3U3Q1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ulk3Q3U3Q1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ulk3Q3U3Q1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ulk3Q3U3Q1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ulk3Q3U3Q1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ulk3Q3U3Q1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ulk3Q3U3Q1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ulk3Q3U3Q1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ulk3Q3U3Q1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ulk3Q3U3Q1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ulk3Q3U3Q1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ulk3Q3U3Q1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ulk3Q3U3Q1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ulk3Q3U3Q1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ulk3Q3U3Q1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ulk3Q3U3Q1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ulk3Q3U3Q1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ulk3Q3U3Q1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ulk3Q3U3Q1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ulk3Q3U3Q1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ulk3Q3U3Q1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ulk3Q3U3Q1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ulk3Q3U3Q1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ulk3Q3U3Q1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ulk3Q3U3Q1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ulk3Q3U3Q1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ulk3Q3U3Q1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ulk3Q3U3Q1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ulk3Q3U3Q1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ulk3Q3U3Q1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ulk3Q3U3Q1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ulk3Q3U3Q1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ulk3Q3U3Q1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ulk3Q3U3Q1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ulk3Q3U3Q1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ulk3Q3U3Q1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ulk3Q3U3Q1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ulk3Q3U3Q1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ulk3Q3U3Q1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ulk3Q3U3Q1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ulk3Q3U3Q1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ulk3Q3U3Q1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ulk3Q3U3Q1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ulk3Q3U3Q1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ulk3Q3U3Q1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ulk3Q3U3Q1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ulk3Q3U3Q1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ulk3Q3U3Q1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ulk3Q3U3Q1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ulk3Q3U3Q1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ulk3Q3U3Q1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ulk3Q3U3Q1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ulk3Q3U3Q1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ulk3Q3U3Q1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ulk3Q3U3Q1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ulk3Q3U3Q1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ulk3Q3U3Q1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ulk3Q3U3Q1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ulk3Q3U3Q1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ulk3Q3U3Q1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ulk3Q3U3Q1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ulk3Q3U3Q1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ulk3Q3U3Q1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ulk3Q3U3Q1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ulk3Q3U3Q1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ulk3Q3U3Q1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ulk3Q3U3Q1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ulk3Q3U3Q1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ulk3Q3U3Q1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ulk3Q3U3Q1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ulk3Q3U3Q1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ulk3Q3U3Q1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ulk3Q3U3Q1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ulk3Q3U3Q1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ulk3Q3U3Q1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ulk3Q3U3Q1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ulk3Q3U3Q1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ulk3Q3U3Q1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms