Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
InipQ3TXT3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
InipQ3TXT3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
InipQ3TXT3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
InipQ3TXT3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
InipQ3TXT3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
InipQ3TXT3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
InipQ3TXT3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
InipQ3TXT3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
InipQ3TXT3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
InipQ3TXT3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
InipQ3TXT3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
InipQ3TXT3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
InipQ3TXT3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
InipQ3TXT3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
InipQ3TXT3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
InipQ3TXT3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
InipQ3TXT3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
InipQ3TXT3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
InipQ3TXT3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
InipQ3TXT3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
InipQ3TXT3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
InipQ3TXT3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
InipQ3TXT3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
InipQ3TXT3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
InipQ3TXT3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
InipQ3TXT3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
InipQ3TXT3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
InipQ3TXT3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
InipQ3TXT3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
InipQ3TXT3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
InipQ3TXT3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
InipQ3TXT3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
InipQ3TXT3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
InipQ3TXT3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
InipQ3TXT3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
InipQ3TXT3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
InipQ3TXT3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
InipQ3TXT3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
InipQ3TXT3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
InipQ3TXT3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
InipQ3TXT3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
InipQ3TXT3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
InipQ3TXT3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
InipQ3TXT3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
InipQ3TXT3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
InipQ3TXT3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
InipQ3TXT3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
InipQ3TXT3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
InipQ3TXT3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
InipQ3TXT3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
InipQ3TXT3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
InipQ3TXT3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
InipQ3TXT3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
InipQ3TXT3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
InipQ3TXT3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
InipQ3TXT3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
InipQ3TXT3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
InipQ3TXT3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
InipQ3TXT3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
InipQ3TXT3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
InipQ3TXT3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
InipQ3TXT3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
InipQ3TXT3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
InipQ3TXT3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
InipQ3TXT3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
InipQ3TXT3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
InipQ3TXT3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
InipQ3TXT3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
InipQ3TXT3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
InipQ3TXT3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
InipQ3TXT3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
InipQ3TXT3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
InipQ3TXT3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
InipQ3TXT3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
InipQ3TXT3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
InipQ3TXT3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
InipQ3TXT3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
InipQ3TXT3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
InipQ3TXT3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
InipQ3TXT3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
InipQ3TXT3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
InipQ3TXT3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
InipQ3TXT3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
InipQ3TXT3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
InipQ3TXT3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
InipQ3TXT3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
InipQ3TXT3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
InipQ3TXT3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
InipQ3TXT3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
InipQ3TXT3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
InipQ3TXT3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
InipQ3TXT3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
InipQ3TXT3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
InipQ3TXT3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
InipQ3TXT3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
InipQ3TXT3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
InipQ3TXT3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
InipQ3TXT3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
InipQ3TXT3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.6 ms