Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWH3

Pnrc1, MCG12570, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnrc1Q3TWH3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pnrc1Q3TWH3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pnrc1Q3TWH3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pnrc1Q3TWH3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pnrc1Q3TWH3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pnrc1Q3TWH3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pnrc1Q3TWH3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pnrc1Q3TWH3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pnrc1Q3TWH3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pnrc1Q3TWH3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pnrc1Q3TWH3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pnrc1Q3TWH3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pnrc1Q3TWH3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pnrc1Q3TWH3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pnrc1Q3TWH3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pnrc1Q3TWH3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pnrc1Q3TWH3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pnrc1Q3TWH3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Pnrc1Q3TWH3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pnrc1Q3TWH3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pnrc1Q3TWH3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pnrc1Q3TWH3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pnrc1Q3TWH3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pnrc1Q3TWH3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pnrc1Q3TWH3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pnrc1Q3TWH3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pnrc1Q3TWH3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pnrc1Q3TWH3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnrc1Q3TWH3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnrc1Q3TWH3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnrc1Q3TWH3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnrc1Q3TWH3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnrc1Q3TWH3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnrc1Q3TWH3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnrc1Q3TWH3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnrc1Q3TWH3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnrc1Q3TWH3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnrc1Q3TWH3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pnrc1Q3TWH3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pnrc1Q3TWH3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pnrc1Q3TWH3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pnrc1Q3TWH3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pnrc1Q3TWH3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pnrc1Q3TWH3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pnrc1Q3TWH3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pnrc1Q3TWH3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pnrc1Q3TWH3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pnrc1Q3TWH3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pnrc1Q3TWH3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pnrc1Q3TWH3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pnrc1Q3TWH3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pnrc1Q3TWH3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pnrc1Q3TWH3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pnrc1Q3TWH3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pnrc1Q3TWH3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pnrc1Q3TWH3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pnrc1Q3TWH3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnrc1Q3TWH3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnrc1Q3TWH3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnrc1Q3TWH3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnrc1Q3TWH3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnrc1Q3TWH3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnrc1Q3TWH3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pnrc1Q3TWH3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pnrc1Q3TWH3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pnrc1Q3TWH3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pnrc1Q3TWH3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pnrc1Q3TWH3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pnrc1Q3TWH3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pnrc1Q3TWH3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pnrc1Q3TWH3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pnrc1Q3TWH3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pnrc1Q3TWH3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pnrc1Q3TWH3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pnrc1Q3TWH3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pnrc1Q3TWH3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pnrc1Q3TWH3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pnrc1Q3TWH3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pnrc1Q3TWH3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pnrc1Q3TWH3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pnrc1Q3TWH3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pnrc1Q3TWH3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnrc1Q3TWH3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnrc1Q3TWH3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnrc1Q3TWH3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnrc1Q3TWH3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnrc1Q3TWH3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnrc1Q3TWH3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pnrc1Q3TWH3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pnrc1Q3TWH3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pnrc1Q3TWH3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pnrc1Q3TWH3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pnrc1Q3TWH3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pnrc1Q3TWH3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnrc1Q3TWH3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnrc1Q3TWH3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnrc1Q3TWH3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnrc1Q3TWH3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnrc1Q3TWH3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pnrc1Q3TWH3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms