Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL54

Trim43a, Tripartite motif-containing protein 43A, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43aQ3TL54 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim43aQ3TL54 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim43aQ3TL54 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim43aQ3TL54 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim43aQ3TL54 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim43aQ3TL54 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim43aQ3TL54 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim43aQ3TL54 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim43aQ3TL54 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trim43aQ3TL54 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim43aQ3TL54 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim43aQ3TL54 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim43aQ3TL54 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim43aQ3TL54 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim43aQ3TL54 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim43aQ3TL54 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim43aQ3TL54 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim43aQ3TL54 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim43aQ3TL54 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim43aQ3TL54 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim43aQ3TL54 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim43aQ3TL54 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim43aQ3TL54 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim43aQ3TL54 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim43aQ3TL54 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim43aQ3TL54 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim43aQ3TL54 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim43aQ3TL54 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim43aQ3TL54 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim43aQ3TL54 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim43aQ3TL54 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim43aQ3TL54 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim43aQ3TL54 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim43aQ3TL54 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim43aQ3TL54 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim43aQ3TL54 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim43aQ3TL54 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim43aQ3TL54 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim43aQ3TL54 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim43aQ3TL54 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim43aQ3TL54 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim43aQ3TL54 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim43aQ3TL54 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim43aQ3TL54 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim43aQ3TL54 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim43aQ3TL54 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim43aQ3TL54 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim43aQ3TL54 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim43aQ3TL54 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim43aQ3TL54 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Trim43aQ3TL54 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim43aQ3TL54 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Trim43aQ3TL54 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim43aQ3TL54 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim43aQ3TL54 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim43aQ3TL54 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim43aQ3TL54 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim43aQ3TL54 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim43aQ3TL54 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim43aQ3TL54 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim43aQ3TL54 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim43aQ3TL54 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim43aQ3TL54 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim43aQ3TL54 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim43aQ3TL54 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim43aQ3TL54 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim43aQ3TL54 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim43aQ3TL54 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim43aQ3TL54 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim43aQ3TL54 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim43aQ3TL54 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim43aQ3TL54 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim43aQ3TL54 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim43aQ3TL54 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim43aQ3TL54 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim43aQ3TL54 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim43aQ3TL54 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trim43aQ3TL54 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim43aQ3TL54 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim43aQ3TL54 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim43aQ3TL54 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim43aQ3TL54 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim43aQ3TL54 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim43aQ3TL54 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim43aQ3TL54 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim43aQ3TL54 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim43aQ3TL54 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim43aQ3TL54 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim43aQ3TL54 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim43aQ3TL54 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim43aQ3TL54 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim43aQ3TL54 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim43aQ3TL54 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim43aQ3TL54 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim43aQ3TL54 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim43aQ3TL54 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim43aQ3TL54 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim43aQ3TL54 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim43aQ3TL54 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim43aQ3TL54 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms