Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ1

Abraxas2, BRISC complex subunit Abraxas 2, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abraxas2Q3TCJ1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abraxas2Q3TCJ1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abraxas2Q3TCJ1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abraxas2Q3TCJ1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abraxas2Q3TCJ1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abraxas2Q3TCJ1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abraxas2Q3TCJ1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abraxas2Q3TCJ1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abraxas2Q3TCJ1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Abraxas2Q3TCJ1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abraxas2Q3TCJ1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abraxas2Q3TCJ1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abraxas2Q3TCJ1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abraxas2Q3TCJ1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abraxas2Q3TCJ1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abraxas2Q3TCJ1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abraxas2Q3TCJ1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abraxas2Q3TCJ1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abraxas2Q3TCJ1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abraxas2Q3TCJ1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abraxas2Q3TCJ1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abraxas2Q3TCJ1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abraxas2Q3TCJ1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abraxas2Q3TCJ1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abraxas2Q3TCJ1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Abraxas2Q3TCJ1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Abraxas2Q3TCJ1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abraxas2Q3TCJ1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abraxas2Q3TCJ1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abraxas2Q3TCJ1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abraxas2Q3TCJ1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Abraxas2Q3TCJ1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Abraxas2Q3TCJ1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Abraxas2Q3TCJ1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Abraxas2Q3TCJ1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Abraxas2Q3TCJ1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Abraxas2Q3TCJ1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Abraxas2Q3TCJ1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Abraxas2Q3TCJ1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Abraxas2Q3TCJ1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Abraxas2Q3TCJ1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abraxas2Q3TCJ1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abraxas2Q3TCJ1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abraxas2Q3TCJ1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abraxas2Q3TCJ1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abraxas2Q3TCJ1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abraxas2Q3TCJ1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abraxas2Q3TCJ1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abraxas2Q3TCJ1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abraxas2Q3TCJ1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abraxas2Q3TCJ1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abraxas2Q3TCJ1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abraxas2Q3TCJ1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abraxas2Q3TCJ1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abraxas2Q3TCJ1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abraxas2Q3TCJ1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abraxas2Q3TCJ1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abraxas2Q3TCJ1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abraxas2Q3TCJ1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abraxas2Q3TCJ1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abraxas2Q3TCJ1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Abraxas2Q3TCJ1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Abraxas2Q3TCJ1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Abraxas2Q3TCJ1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Abraxas2Q3TCJ1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Abraxas2Q3TCJ1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abraxas2Q3TCJ1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abraxas2Q3TCJ1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abraxas2Q3TCJ1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abraxas2Q3TCJ1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Abraxas2Q3TCJ1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Abraxas2Q3TCJ1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Abraxas2Q3TCJ1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Abraxas2Q3TCJ1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Abraxas2Q3TCJ1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abraxas2Q3TCJ1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abraxas2Q3TCJ1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abraxas2Q3TCJ1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abraxas2Q3TCJ1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abraxas2Q3TCJ1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abraxas2Q3TCJ1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abraxas2Q3TCJ1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abraxas2Q3TCJ1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abraxas2Q3TCJ1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abraxas2Q3TCJ1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abraxas2Q3TCJ1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abraxas2Q3TCJ1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abraxas2Q3TCJ1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Abraxas2Q3TCJ1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Abraxas2Q3TCJ1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Abraxas2Q3TCJ1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Abraxas2Q3TCJ1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Abraxas2Q3TCJ1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Abraxas2Q3TCJ1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Abraxas2Q3TCJ1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Abraxas2Q3TCJ1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abraxas2Q3TCJ1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abraxas2Q3TCJ1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abraxas2Q3TCJ1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abraxas2Q3TCJ1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms