Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hddc2Q3SXD3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hddc2Q3SXD3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hddc2Q3SXD3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hddc2Q3SXD3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hddc2Q3SXD3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hddc2Q3SXD3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hddc2Q3SXD3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hddc2Q3SXD3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hddc2Q3SXD3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hddc2Q3SXD3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hddc2Q3SXD3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hddc2Q3SXD3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hddc2Q3SXD3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hddc2Q3SXD3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hddc2Q3SXD3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hddc2Q3SXD3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hddc2Q3SXD3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hddc2Q3SXD3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hddc2Q3SXD3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hddc2Q3SXD3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hddc2Q3SXD3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hddc2Q3SXD3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hddc2Q3SXD3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hddc2Q3SXD3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hddc2Q3SXD3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hddc2Q3SXD3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hddc2Q3SXD3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hddc2Q3SXD3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hddc2Q3SXD3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hddc2Q3SXD3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hddc2Q3SXD3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hddc2Q3SXD3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hddc2Q3SXD3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hddc2Q3SXD3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hddc2Q3SXD3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hddc2Q3SXD3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hddc2Q3SXD3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hddc2Q3SXD3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hddc2Q3SXD3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hddc2Q3SXD3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hddc2Q3SXD3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hddc2Q3SXD3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hddc2Q3SXD3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hddc2Q3SXD3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hddc2Q3SXD3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hddc2Q3SXD3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hddc2Q3SXD3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hddc2Q3SXD3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hddc2Q3SXD3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hddc2Q3SXD3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hddc2Q3SXD3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hddc2Q3SXD3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hddc2Q3SXD3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hddc2Q3SXD3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hddc2Q3SXD3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hddc2Q3SXD3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hddc2Q3SXD3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hddc2Q3SXD3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hddc2Q3SXD3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hddc2Q3SXD3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hddc2Q3SXD3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hddc2Q3SXD3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hddc2Q3SXD3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hddc2Q3SXD3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hddc2Q3SXD3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hddc2Q3SXD3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hddc2Q3SXD3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hddc2Q3SXD3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hddc2Q3SXD3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hddc2Q3SXD3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hddc2Q3SXD3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hddc2Q3SXD3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hddc2Q3SXD3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hddc2Q3SXD3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hddc2Q3SXD3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hddc2Q3SXD3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hddc2Q3SXD3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hddc2Q3SXD3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hddc2Q3SXD3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hddc2Q3SXD3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hddc2Q3SXD3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hddc2Q3SXD3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hddc2Q3SXD3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hddc2Q3SXD3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hddc2Q3SXD3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hddc2Q3SXD3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hddc2Q3SXD3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hddc2Q3SXD3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hddc2Q3SXD3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hddc2Q3SXD3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hddc2Q3SXD3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hddc2Q3SXD3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hddc2Q3SXD3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hddc2Q3SXD3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hddc2Q3SXD3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hddc2Q3SXD3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hddc2Q3SXD3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hddc2Q3SXD3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hddc2Q3SXD3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms