Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF22

Ccdc138, Coiled-coil domain-containing protein 138, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc138Q0VF22 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc138Q0VF22 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc138Q0VF22 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc138Q0VF22 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc138Q0VF22 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc138Q0VF22 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc138Q0VF22 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc138Q0VF22 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc138Q0VF22 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc138Q0VF22 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc138Q0VF22 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc138Q0VF22 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc138Q0VF22 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc138Q0VF22 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc138Q0VF22 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc138Q0VF22 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc138Q0VF22 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc138Q0VF22 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc138Q0VF22 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc138Q0VF22 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc138Q0VF22 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc138Q0VF22 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc138Q0VF22 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc138Q0VF22 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc138Q0VF22 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc138Q0VF22 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc138Q0VF22 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc138Q0VF22 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc138Q0VF22 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc138Q0VF22 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc138Q0VF22 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc138Q0VF22 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc138Q0VF22 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc138Q0VF22 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc138Q0VF22 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc138Q0VF22 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc138Q0VF22 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc138Q0VF22 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc138Q0VF22 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc138Q0VF22 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc138Q0VF22 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc138Q0VF22 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc138Q0VF22 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc138Q0VF22 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc138Q0VF22 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc138Q0VF22 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc138Q0VF22 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc138Q0VF22 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc138Q0VF22 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc138Q0VF22 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc138Q0VF22 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc138Q0VF22 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc138Q0VF22 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc138Q0VF22 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc138Q0VF22 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc138Q0VF22 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc138Q0VF22 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc138Q0VF22 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc138Q0VF22 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc138Q0VF22 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc138Q0VF22 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc138Q0VF22 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc138Q0VF22 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc138Q0VF22 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc138Q0VF22 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc138Q0VF22 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc138Q0VF22 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc138Q0VF22 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc138Q0VF22 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc138Q0VF22 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc138Q0VF22 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc138Q0VF22 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc138Q0VF22 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc138Q0VF22 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc138Q0VF22 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc138Q0VF22 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc138Q0VF22 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc138Q0VF22 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc138Q0VF22 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc138Q0VF22 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc138Q0VF22 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc138Q0VF22 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc138Q0VF22 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc138Q0VF22 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc138Q0VF22 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc138Q0VF22 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc138Q0VF22 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc138Q0VF22 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc138Q0VF22 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc138Q0VF22 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc138Q0VF22 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc138Q0VF22 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc138Q0VF22 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc138Q0VF22 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc138Q0VF22 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc138Q0VF22 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc138Q0VF22 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc138Q0VF22 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc138Q0VF22 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc138Q0VF22 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.1 ms