Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ssrp1Q08943 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ssrp1Q08943 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ssrp1Q08943 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ssrp1Q08943 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ssrp1Q08943 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ssrp1Q08943 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ssrp1Q08943 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ssrp1Q08943 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ssrp1Q08943 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ssrp1Q08943 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ssrp1Q08943 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ssrp1Q08943 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ssrp1Q08943 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ssrp1Q08943 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ssrp1Q08943 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ssrp1Q08943 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ssrp1Q08943 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ssrp1Q08943 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ssrp1Q08943 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ssrp1Q08943 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ssrp1Q08943 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ssrp1Q08943 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ssrp1Q08943 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ssrp1Q08943 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ssrp1Q08943 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ssrp1Q08943 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ssrp1Q08943 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ssrp1Q08943 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ssrp1Q08943 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ssrp1Q08943 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ssrp1Q08943 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ssrp1Q08943 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ssrp1Q08943 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ssrp1Q08943 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ssrp1Q08943 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ssrp1Q08943 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ssrp1Q08943 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ssrp1Q08943 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ssrp1Q08943 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ssrp1Q08943 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ssrp1Q08943 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ssrp1Q08943 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ssrp1Q08943 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ssrp1Q08943 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ssrp1Q08943 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ssrp1Q08943 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ssrp1Q08943 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ssrp1Q08943 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ssrp1Q08943 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ssrp1Q08943 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ssrp1Q08943 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ssrp1Q08943 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ssrp1Q08943 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ssrp1Q08943 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ssrp1Q08943 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ssrp1Q08943 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ssrp1Q08943 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ssrp1Q08943 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ssrp1Q08943 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ssrp1Q08943 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ssrp1Q08943 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ssrp1Q08943 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ssrp1Q08943 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ssrp1Q08943 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ssrp1Q08943 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ssrp1Q08943 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ssrp1Q08943 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ssrp1Q08943 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ssrp1Q08943 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ssrp1Q08943 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ssrp1Q08943 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ssrp1Q08943 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ssrp1Q08943 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ssrp1Q08943 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ssrp1Q08943 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ssrp1Q08943 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ssrp1Q08943 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ssrp1Q08943 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ssrp1Q08943 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ssrp1Q08943 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ssrp1Q08943 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ssrp1Q08943 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ssrp1Q08943 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ssrp1Q08943 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ssrp1Q08943 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ssrp1Q08943 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ssrp1Q08943 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ssrp1Q08943 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ssrp1Q08943 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ssrp1Q08943 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ssrp1Q08943 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ssrp1Q08943 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ssrp1Q08943 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ssrp1Q08943 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ssrp1Q08943 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ssrp1Q08943 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ssrp1Q08943 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ssrp1Q08943 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ssrp1Q08943 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms