Protein–RNA interactions for Protein: Q08775

Runx2, Runt-related transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx2Q08775 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Runx2Q08775 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Runx2Q08775 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Runx2Q08775 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Runx2Q08775 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Runx2Q08775 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Runx2Q08775 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Runx2Q08775 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Runx2Q08775 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Runx2Q08775 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Runx2Q08775 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Runx2Q08775 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Runx2Q08775 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Runx2Q08775 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Runx2Q08775 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Runx2Q08775 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Runx2Q08775 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Runx2Q08775 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Runx2Q08775 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Runx2Q08775 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Runx2Q08775 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Runx2Q08775 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Runx2Q08775 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Runx2Q08775 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Runx2Q08775 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Runx2Q08775 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Runx2Q08775 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Runx2Q08775 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Runx2Q08775 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Runx2Q08775 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Runx2Q08775 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Runx2Q08775 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Runx2Q08775 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Runx2Q08775 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Runx2Q08775 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Runx2Q08775 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Runx2Q08775 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Runx2Q08775 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Runx2Q08775 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Runx2Q08775 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Runx2Q08775 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Runx2Q08775 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Runx2Q08775 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Runx2Q08775 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Runx2Q08775 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Runx2Q08775 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Runx2Q08775 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Runx2Q08775 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Runx2Q08775 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Runx2Q08775 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Runx2Q08775 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Runx2Q08775 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Runx2Q08775 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Runx2Q08775 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Runx2Q08775 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Runx2Q08775 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Runx2Q08775 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Runx2Q08775 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Runx2Q08775 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Runx2Q08775 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Runx2Q08775 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Runx2Q08775 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Runx2Q08775 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Runx2Q08775 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Runx2Q08775 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Runx2Q08775 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Runx2Q08775 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Runx2Q08775 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Runx2Q08775 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Runx2Q08775 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Runx2Q08775 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Runx2Q08775 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Runx2Q08775 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Runx2Q08775 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Runx2Q08775 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Runx2Q08775 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Runx2Q08775 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Runx2Q08775 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Runx2Q08775 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Runx2Q08775 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Runx2Q08775 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Runx2Q08775 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Runx2Q08775 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Runx2Q08775 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Runx2Q08775 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Runx2Q08775 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Runx2Q08775 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Runx2Q08775 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Runx2Q08775 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Runx2Q08775 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Runx2Q08775 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Runx2Q08775 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Runx2Q08775 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Runx2Q08775 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Runx2Q08775 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Runx2Q08775 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Runx2Q08775 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Runx2Q08775 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Runx2Q08775 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Runx2Q08775 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms